senare arbete: ”Mississippi Burning” och ”Unforgiven”
Hackman fortsatte att utforska olika genrer och typer av tecken under resten av decenniet. Med Hoosiers (1986) tacklade han rollen som en ny tränare som leder ett litet basketlag till seger. Han spelade sedan en olycksbådande försvarsminister på ingen väg ut (1987), med Kevin Costner.
Hackman levererade en annan stark tur i Mississippi Burning (1988)., I denna historiska dramatiska thriller baserad på en sann historia spelade han en FBI-agent som undersökte mordet på tre Civil rights workers 1964, en prestation som gav honom en bästa Actor Academy Award nominering. Inte långt efteråt upplevde Hackman bröstsmärtor och genomgick en angioplastik. Han ansåg pensionering ett tag, men återvände så småningom till sitt hantverk.
arbeta med en annan hyllad film talang, Clint Eastwood, Hackman netted en Oscar för bästa stödjande skådespelare för Unforgiven (1992)., I denna västerländska spelade han en grym sheriff förföljd av Eastwood, som också vann en Oscar för Bästa regissör. Med en annan typ av moraliskt tvivelaktig karaktär spelade Hackman Tom Cruise mentor i företaget (1993), en filmanpassning av en John Grisham-roman.
1995, Hackman spelade kryddat bekämpa ubåt kapten Frank Ramsey mittemot Denzel Washingtons örlogskapten Ron Hunter i spännande drama Crimson Tide., Samma år spelade han som John Herod, en ond borgmästare i en vild gränsstad mittemot Sharon Stone, Russell Crowe och den då kommande skådespelaren Leonardo DiCaprio i västra the Quick and The Dead. 1996 spelade han i en annan Grisham-anpassning, the Chamber, som en dömd mördare och rasistisk inför avrättning. Filmen slog ut med kritiker och film-goers både, Men Hackman hade bättre tur det året som en konservativ senator i komedin The Birdcage, med Robin Williams.,
av 2000-talet började med Hackman visas som Tränare Jimmy McGinty i fotboll komedi The Replacements, mittemot Keanu Reeves och Jack Warden. Samma år hittade han också huvudrollen tillsammans med Morgan Freeman i brott thriller under misstanke. I 2001, Hackman rubricerade ensemble av Wes Anderson är udda familj komedi The Royal Tenenbaums. Anjelica Huston spelade med som sin fru och Ben Stiller, Gwyneth Paltrow och Luke Wilson spelade sina vuxna barn., Det året spelade Hackman också i Heartbreakers som en rik änkling riktad av en guldgrävande mor och dotter, spelad av Sigourney Weaver och Jennifer Love Hewitt. År 2003 fick Hackman en chans att arbeta med gammal vän Hoffman i Runaway Jury, som också spelade John Cusack. Han spelade en jurykonsult som arbetade för en vapentillverkare i en kostym som Hoffmans klient har tagit emot företaget.,
Hackmans senaste filmprojekt var den ljushjärtade komedin Welcome to Mooseport (2004), där han spelade som en före detta president som kampanjer mot en lokal (Ray Romano) för att bli borgmästare i en liten stad. Samtidigt som han marknadsför filmen uppträdde Hackman på Larry King Show och sa att han inte hade ett annat filmprojekt uppradade och tillade att hans filmkarriär var ”förmodligen överallt.”