Bibliografie >> Microarray
Tehnologia Microarray
|
Cum tehnologia microarray funcționează?
|
Bacteriene de identificare folosind microarrays
|
mutatii genetice detectare folosind microarrays
|
Introducere în Microarray
cercetări de Biologie Moleculară evoluează prin dezvoltarea de tehnologii utilizate pentru realizarea acestora., Nu este posibilă cercetarea unui număr mare de gene folosind metode tradiționale. Microarray ADN este o astfel de tehnologie care permite cercetătorilor să investigheze și să abordeze problemele care au fost odată considerate a fi trasabile. Se poate analiza expresia multor gene într-o singură reacție rapid și într-o manieră eficientă. Tehnologia microarray ADN a împuternicit comunitatea științifică să înțeleagă aspectele fundamentale care subliniază creșterea și dezvoltarea vieții, precum și să exploreze cauzele genetice ale anomaliilor care apar în funcționarea corpului uman.,
un experiment tipic microarray implică hibridizarea unei molecule de ARNm la șablonul ADN din care provine. Multe probe de ADN sunt folosite pentru a construi o matrice. Cantitatea de ARNm legată de fiecare sit din matrice indică nivelul de Expresie al diferitelor gene. Acest număr poate rula în mii. Toate datele sunt colectate și un profil este generat pentru expresia genelor în celulă.
tehnica Microarray
un tablou este un aranjament ordonat al probelor în care potrivirea probelor de ADN cunoscute și necunoscute se face pe baza regulilor de împerechere de bază., Un experiment matrice face uz de sisteme comune de testare, cum ar fi microplăci sau membrane standard sugativă. Dimensiunile eșantionului sunt de obicei mai mici de 200 microni în diametru, de obicei, conțin mii de pete.
mii de probe reperate cunoscute sub numele de sonde (cu identitate cunoscută) sunt imobilizate pe un suport solid (un microscop slide-uri de sticlă sau chips-uri de siliciu sau membrană de nailon). Petele pot fi ADN, cDNA sau oligonucleotide. Acestea sunt utilizate pentru a determina legarea complementară a secvențelor necunoscute, permițând astfel analiza paralelă pentru expresia genelor și descoperirea genelor., Un experiment cu un singur cip ADN poate furniza informații despre mii de gene simultan. Un aranjament ordonat al sondelor pe suport este important, deoarece locația fiecărui punct de pe matrice este utilizată pentru identificarea unei gene.
Tipuri de Microarrays
în Funcție de tipul de imobilizat eșantionul utilizat construi tablouri și informații preluat, Microarray experimente pot fi clasificate în trei moduri:
1., Analiza expresiei Microarray: în această configurație experimentală, ADNc derivat din ARNm al genelor cunoscute este imobilizat. Proba are gene atât din țesuturile normale, cât și din cele bolnave. Spoturile cu mai multă intensitate sunt obținute pentru gena țesutului bolnav dacă gena este exprimată în starea bolnavă. Acest model de Expresie este apoi comparat cu modelul de Expresie al unei gene responsabile de o boală.
2. Microarray pentru analiza mutației: pentru această analiză, cercetătorii folosesc gDNA. Genele pot diferi unele de altele cu cât mai puțin cu o singură bază nucleotidică.,
o singură diferență de bază între două secvențe este cunoscută sub numele de polimorfism nucleotidic unic (SNP) și detectarea lor este cunoscută sub numele de detectare SNP.
3. Hibridizare genomică comparativă: se utilizează pentru identificarea în creșterea sau scăderea fragmentelor cromozomiale importante care adăpostesc gene implicate într-o boală.
aplicații ale Microarrays
descoperirea genelor: tehnologia microarray ADN ajută la identificarea de noi gene, știu despre nivelurile lor de funcționare și de exprimare în diferite condiții.,diagnosticul bolii: tehnologia microarray ADN ajută cercetătorii să afle mai multe despre diferite boli, cum ar fi bolile de inimă, bolile mintale, bolile infecțioase și, în special, studiul cancerului. Până de curând, diferite tipuri de cancer au fost clasificate pe baza organelor în care se dezvoltă tumorile. Acum, odată cu evoluția tehnologiei microarray, va fi posibil ca cercetătorii să clasifice în continuare tipurile de cancer pe baza modelelor de activitate genică din celulele tumorale., Acest lucru va ajuta enorm comunitatea farmaceutică să dezvolte medicamente mai eficiente, deoarece strategiile de tratament vor fi direcționate direct către tipul specific de cancer.descoperirea medicamentelor: tehnologia Microarray are o aplicare extensivă în Farmacogenomică. Farmacogenomica este studiul corelațiilor dintre răspunsurile terapeutice la medicamente și profilurile genetice ale pacienților. Analiza comparativă a genelor dintr-o celulă bolnavă și normală va ajuta la identificarea Constituției biochimice a proteinelor sintetizate de genele bolnave., Cercetatorii pot folosi aceste informații pentru a sintetiza medicamente care luptă cu aceste proteine și de a reduce efectul lor.cercetare toxicologică: tehnologia Microarray oferă o platformă robustă pentru cercetarea impactului toxinelor asupra celulelor și transmiterea lor către descendenți. Toxicogenomica stabilește corelația dintre răspunsurile la toxici și modificările profilurilor genetice ale celulelor expuse la astfel de toxici.în trecutul recent, tehnologia microarray a fost utilizată pe scară largă de comunitatea științifică., În consecință, de-a lungul anilor, a existat o mulțime de generare de date legate de expresia genelor. Aceste date sunt împrăștiate și nu sunt ușor disponibile pentru uz public. Pentru facilitarea accesibilității la aceste date, Centrul Național pentru Informații Biotehnologice (NCBI) a formulat expresia genică Omnibus sau GEO. Este o facilitate de depozit de date care include date privind expresia genelor din surse variate.,v id=”0052483fe5″>
Other Parameters
-
Probe Location
1., 3 ‘end bias: oligos ales ar trebui să fie spre 3’ sfârșitul genei adică implicit: 3 ‘ end.
2. Oligos ar trebui să fie proiectate în mod implicit în 999 baze de 3′ end. Intervalul poate fi de la 0 la 1500 de baze.oligo-urile ar trebui să fie lipsite de omologie încrucișată (adică ar trebui să fie căutate în funcție de categoria genomului corespunzător).