Bibliografie >> mutatii genetice
mutatii genetice imagine de Ansamblu & Tehnici
mutatii genetice Introducere
Gene despicare este un post-transcripțional modificarea în care o singură genă poate un cod pentru mai multe proteine. Îmbinarea genelor se face în eucariote, înainte de traducerea ARNm, prin includerea sau excluderea diferențială a regiunilor pre-ARNm. Îmbinarea genelor este o sursă importantă de diversitate a proteinelor., În timpul unui eveniment tipic de îmbinare a genelor, pre-ARNm transcris dintr-o genă poate duce la diferite molecule mature de ARNm care generează mai multe proteine funcționale. Astfel, îmbinarea genelor permite unei singure gene să-și mărească capacitatea de codificare, permițând sinteza izoformelor proteice care sunt distincte din punct de vedere structural și funcțional. Gene splicing se observă în proporție mare de gene. În celulele umane, aproximativ 40-60% dintre gene sunt cunoscute pentru a prezenta o îmbinare alternativă.,
mutatii genetice Mecanism
Există mai multe tipuri de frecvente mutații genetice evenimente. Acestea sunt evenimentele care pot apărea simultan în gene după ce ARNm este format din etapa de transcriere a dogmei centrale a biologiei moleculare. omiterea exonului: acesta este cel mai frecvent cunoscut mecanism de îmbinare a genelor în care exonii sunt incluși sau excluși din transcrierea finală a genelor, ceea ce duce la variante de ARNm extinse sau scurtate., Exonii sunt regiunile de codificare ale unei gene și sunt responsabile pentru producerea de proteine care sunt utilizate în diferite tipuri de celule pentru o serie de funcții.
retenția Intronului: un eveniment în care un intron este reținut în transcrierea finală. La om, s-a raportat că 2-5% din gene rețin intronii. Mecanismul de îmbinare a genelor păstrează porțiunile necodificate (junk) ale genei și conduce la o demornitate în structura și funcționalitatea proteinei.
Alternative 3 ‘Splice Site-ul și 5′ Splice Site-ul: gene alternative splicing include aderarea la diferite 5’ și 3 ‘ splice site-ul., În acest tip de gene despicare, două sau mai multe alternative 5′ splice site-ul concura pentru aderarea la două sau mai multe alternative 3’ splice site-ul.metoda de detectare a variantelor de îmbinare a genelor conduce la sinteza proteinelor alternative care joacă un rol important în fiziologia și boala umană. În prezent, cele mai eficiente metode de detectare la scară largă a variantelor de îmbinare includ metode de predicție computațională și analiză microarray. Microarray based splice variant detection este cea mai populară metodă utilizată în prezent., Natura extrem de paralelă și sensibilă a microarrays le face ideale pentru monitorizarea expresiei genelor la un nivel specific țesutului, la nivel de genom. Metodele bazate pe Microarray pentru detectarea variantelor de îmbinare oferă o platformă robustă și scalabilă pentru descoperirea cu randament ridicat a îmbinării alternative a genelor. Un număr de transcrieri genetice noi au fost detectate folosind metode bazate pe microarray care nu au fost detectate de ESTs folosind Metode computaționale. O altă metodă frecvent utilizată pentru descoperirea izoformelor genetice noi este RT-PCR urmată de secvențiere., Aceasta este o abordare puternică și poate fi utilizată eficient pentru analizarea unui număr mic de gene. Cu toate acestea, oferă doar o viziune limitată asupra structurii genei, este intensivă pentru muncă și nu se scalează cu ușurință la mii de gene sau sute de țesuturi.
provocări în proiectarea Microarray pentru detectarea variantelor de îmbinare
detectarea de îmbinare a genelor pe bază de Microarray prezintă unele provocări unice în proiectarea sondelor pentru izoforme care prezintă un grad ridicat de omologie., Pentru a diferenția între aceste izoforme, se utilizează o microarray care utilizează o combinație de sonde pentru exoni și joncțiuni exon-exon. Exon sărind peste evenimente sau alte ștergeri pot fi monitorizate prin utilizarea sondelor de joncțiune. De exemplu, o sondă care acoperă exonul 1 și exonul 3 al genei va detecta sărirea exonului 2 din gena care este tradusă într-o proteină.
Software pentru proiectarea microarrays variante Splice
AlleleID ® proiectează automat sonde de joncțiune, precum și sonde intra-exon., Cu AlleleID® puteți proiecta orice combinație de sonde pentru a detecta orice tip de eveniment alternativ de îmbinare.