a trecut Un an de la evenimentele de la „Zero Requiem”, un sistem de Împărat Lelouch vi Britannia formulate la sfârșitul conflict cu moartea lui, și Nunnally vi Britannia reguli Britannia în timp ce beneficiază de ajutor de garda ei de corp Suzaku Kururugi, care a preluat identitatea de Zero. Nunnally și Suzaku se află în mijlocul unei vizite de bunăvoință într-o națiune deșert atunci când sunt ambuscați de o echipă Knightmare; Suzaku este ușor învins și sunt răpiți., Cei doi se află în custodia Shalio și Shamna, fratele conducătorii Regatului Zilkhistan care a avut de suferit din lume pace crippling lor principale de export: mercenary soldiers. Shamna explică planul lor de a folosi Nunnally pentru a accesa inconștiență colectivă în C e Lume pentru a restabili Zilkhistan politice s-ar putea.
Suspecta Zilkhistan implicarea lui Kallen Stadtfeld, Sayoko Shinozaki, și Lloyd Asplund se infiltreze în țară și a alerga în C. C. și un fizic înviat, dar fără suflet Lelouch. C. C., explică faptul că, după Zero Requiem, școala lor prieten Shirley Fenette contrabandă Lelouch cadavrul lui pentru ea și că a înviat Lelouch din morți, prin reconstrucția cadavrului lui, dar amintirile și personalitatea sunt prinși în imaginarul colectiv. Grupul lansează un atac asupra unei închisori din Zilkhistan, unde îl salvează pe Suzaku și descoperă o poartă Aramu, un portal către Lumea lui C. C. C. folosește portalul pentru a reînvia complet Lelouch., Lelouch din nou dons manta de Zero și se întâlnește cu Britannian forțele conduse de sora sa vitregă, Cornelia li Britannia și fostul său locotenent Kaname Ohgi.forțele lui Lelouch o urmăresc pe Nunnally și o găsesc într-un templu din Zilkhistan. Lelouch se infiltrează în templu și o ucide pe Shamna, dar ea își activează Geass și călătorește înapoi șase ore în trecut, permițându-i să prezică perfect acțiunile lui Lelouch. Lelouch își folosește priceperea tactică pentru a deduce mecanica lui Shamna și o bate afară. El eliberează Nunnally, dar află că mintea ei a fost transportată în lumea lui C. C. C., îl îndrumă în inconștiența colectivă și salvează cu succes Nunnally. Suzaku îl ucide pe Shalio în luptă, distrugând-o pe Shamna permanent. În urma, Lelouch din nou lasa mostenire titlul de Zero la Suzaku și pleacă într-o călătorie cu C. C., având pseudonimul L. L. ca ideea lui de o propunere de căsătorie.
Într-o scenă post-credite stabilit într-un viitor nedeterminat, L. L. și C. C. sunt prezentate în picioare peste o groapă comună, într-o pădure, cu L. L. precizând că va lua Geass de cei care-l exercite fără rezolva., Acest post-credit scena a servit ca setup pentru filmul este drama imagine unde Lelouch și C. C. confruntat cu un pirat și C. C. a luat Geass.