arboretul este amplasat pe o porțiune rămasă din Rancho Santa Anita, una dintre subvențiile Funciare mexicane din California de Sud. Rancho Santa Anita a fost neobișnuit prin faptul că a fost situat deasupra unei mari părți a acviferului bazinului Raymond. Trei iazuri sag și numeroase izvoare au fost găsite în zonă, iar singurul rămas este acum numit Baldwin Lake. Lacy Park din orașul San Marino a fost odată un alt iaz sag, iar locația exactă a celui de-al treilea nu este cunoscută, dar ar fi putut fi pe baza bibliotecii Huntington și a Grădinii Botanice., Ca o consecință a abundenței relative a apei, a fost o zonă importantă în preistorie ca sursă de apă pe tot parcursul anului, corpul de apă cunoscut sub numele de Lacul Baldwin și celelalte iazuri sag au atras atât păsări de apă, cât și alte animale, precum și americani nativi. Nu este surprinzator prezența apei și joc creat o permanentă Nativ American locuire în zonă și se crede că a fost locul de Tongva satul Aleupkigna., Apropierea de Misiunea San Gabriel din apropiere ar fi putut duce la construirea unei mici locuințe sezoniere la situl Arboretum pentru păstori sau vânători, ceea ce a dus în cele din urmă la construirea unei structuri modeste de adobe.în 1839, subvenția acordată lui Rancho Santa Anita a fost acordată lui Hugo Reid (1809-1852) și soției sale Tongva, Victoria. Reid a construit o casă adobe lângă lac în 1839, acum un reper istoric din California. Reid a fost un scoțian educat cunoscut pentru o serie de scrisori care descriu cultura Tongva., În caz contrar, Reid a fost probabil cel mai bine cunoscut pentru rolul său în Convenția Constituțională din California din 1849. Afectat de tuberculoză, a murit la vârsta de 43 de ani. Au urmat o serie de proprietari pe termen scurt ai proprietății, Rancho Santa Anita.
Ulterior proprietarii de Rancho Santa Anita au fost, în ordine, Henry Dalton, Joseph A. Rowe, Albert Gipson, în parteneriat cu William Corbett și Domnul Barker, Leonard Rose și William Wolfskill, Alfred Chapman cu Harris Newmark, până când în cele din urmă proprietatea a fost vândută la Elias Jackson Baldwin., Cu fiecare tranziție, începând cu vânzarea către Rose și Wolfskill, o parte din fermă a fost vândută. Fiecare proprietar în unele moduri tipifică istoria California de Sud în timpul perioadei. Inovația agricolă este o caracteristică care a persistat profitând de climă și de noile culturi pe care le-a făcut posibile, precum și de un număr tot mai mare de consumatori și de noi piețe deschise de inovațiile din domeniul transporturilor.în 1875, când Elias Jackson „Lucky” Baldwin a cumpărat Rancho Santa Anita și și-a construit clădirile și terenurile., Influența lui Baldwin a avut o flamboyance care a fost evidentă în crearea unei vitrine la Hotelul Oakwood și la pista de curse Santa Anita. Viticultura comercială a înflorit în jurul misiunii San Gabriel din zilele misiunii. Baldwin a început o vinărie premiată pentru a furniza turiștilor, a vândut teren coloniștilor, precum și a condus o companie privată de apă și lucrări de cărămidă. Un parteneriat cu Henry E. Huntington și Santa Fe Railroad asigurat că pasagerii ar putea ajunge pe calea ferată din Los Angeles și alte locații, precum și aducerea de mărfuri, cum ar fi materiale de construcții și produse de fermă de nave.,arboretul a început în 1947, California și Los Angeles achiziționând în comun 111 acri (44,9 ha) pentru a crea un arboretum în jurul sitului Baldwin. Până în 1949, a fost construită prima seră, iar plantele sitului au fost inventariate. În 1951, au fost plantați primii 1.000 de copaci, iar în 1956 arboretul a fost deschis publicului. Construcția în curs de desfășurare a grădinilor și serelor a avut loc în anii 1950 și 1960, iar în anii 1975-1976 a fost deschisă sera tropicală, iar grădina preistorică și jungla a fost finalizată. Construcția și renovarea atât a serelor, cât și a grădinilor continuă.,
reîncărcare a apelor Subterane iazuri și o stație de pompare a fost propus de Los Angeles County Departamentul de Lucrări Publice și un consorțiu de cinci poalele orașe pentru 4 hectare (1,6 ha) din Australia secțiune.