têm uma extremidade fosforil (5′) e uma extremidade hidroxil (3′). Esta notação segue da nomenclatura química orgânica, e pode ser usada para definir o movimento de enzimas como polimerases de DNA em relação à cadeia de DNA de uma forma não-arbitrária.
G-quadruplexesEdit
diferentes tipos de topologias em G-quadruplex, hélice, lateral e diagonal.,
g-quadruplices, também conhecido como G4 DNA são estruturas secundárias encontradas em ácidos nucleicos que são ricos em guanina. Estas estruturas estão normalmente localizadas nos telómeros (extremidades dos cromossomas). O G-quadruplex pode ser paralelo ou antiparalel, dependendo da configuração do loop, que é um componente da estrutura. Se todas as cadeias de DNA funcionam na mesma direção, é chamado de um quadruplex paralelo, e é conhecido como uma cadeia-reversão/hélice, conectando cadeias paralelas adjacentes., Se uma ou mais cadeias de ADN correrem na direcção oposta, é denominado como um quadruplex anti-paralelo, e pode ser quer sob a forma de trens laterais/orlas, ligando cadeias anti-paralelas adjacentes, quer sob a forma de uma diagonal, unindo duas cadeias diagonalmente opostas. A estrutura destes quadruplexos G pode ser determinada por um catião.artigo principal: replicação de ADN
no ADN, o carbono de 5′ está localizado no topo da cadeia principal, e o carbono de 3′ está localizado na secção inferior da cadeia retardada., As sequências de ácido nucleico são complementares e paralelas,mas elas vão em direções opostas, daí a designação antiparalél. A estrutura antiparalelada do DNA é importante na replicação do DNA porque ele replica a cadeia líder de uma maneira e a cadeia retardada de outra maneira. Durante a replicação do DNA, a cadeia líder é replicada continuamente, enquanto a cadeia retardada é replicada em segmentos conhecidos como fragmentos de Okazaki.,
anti-parallelismo em biochemistryEdit
a importância de uma estrutura antiparalelal de dupla hélice de ADN é devido à sua ligação de hidrogénio entre os pares de bases azotadas complementares. Se a estrutura de DNA fosse paralela, a ligação de hidrogênio não seria possível, já que os pares de base não seriam emparelhados da maneira conhecida. Os quatro pares de base são: adenina, guanina, citosina e timina, onde a adenina complementa a timina, e guanina complementa a citosina., A transcrição seria outro problema se a estrutura do DNA fosse paralela, não fazendo sentido da informação que está sendo lida a partir do DNA. Isto conduziria ainda à produção de proteínas incorrectas.