cząsteczki kwasu nukleinowego mają koniec fosforylowy (5′) i koniec hydroksylowy (3′). Ta notacja wynika z nomenklatury chemii organicznej i może być używana do określenia ruchu enzymów, takich jak polimerazy DNA w stosunku do nici DNA w sposób nie arbitralny.
g-quadruplexesEdit
różne typy topologii w G-quadruplexes, propeller, lateral, and diagonal.,
g-kwadruplexy, znane również jako g4 DNA są drugorzędnymi strukturami występującymi w kwasach nukleinowych, które są bogate w guaninę. Struktury te są zwykle zlokalizowane na telomerach (końcach chromosomów). G-quadruplex może być równoległy lub antyparalelny w zależności od konfiguracji pętli, która jest składową struktury. Jeśli wszystkie nici DNA przebiegają w tym samym kierunku, określa się je jako czworokąt równoległy, a nazywa się je pasmem odwróconym / śrubowym, łączącym sąsiadujące równoległe pasma., Jeśli jedna lub więcej nici DNA biegnie w przeciwnym kierunku, jest ona określana jako czworokąt anty-równoległy i może być albo w formie bocznej / krawędziowej, łączącej sąsiadujące pasma anty-równoległe, lub po przekątnej, łącząc dwie przeciwległe pasma. Struktura tych czworokątów G może być określona przez kation.
replikacja DNA
w DNA węgiel 5′ znajduje się w górnej części wiodącej nici, a węgiel 3′ znajduje się w dolnej części opóźnionej nici., Sekwencje kwasów nukleinowych są komplementarne i równoległe, ale idą w przeciwnych kierunkach, stąd oznaczenie antyparalelne. Antyparallel struktura DNA jest znacząco w DNA replikacja ponieważ replikuje wiodącą nić jeden sposób i opóźniający nić drugi sposób. Podczas replikacji DNA wiodąca nić jest replikowana w sposób ciągły, podczas gdy nić opóźniająca jest replikowana w segmentach znanych jako fragmenty Okazaki.,
antyrównoległość w biochemii
znaczenie antyrównoległej struktury podwójnej helisy DNA wynika z wiązania wodorowego między uzupełniającymi się parami zasad azotowych. Gdyby struktura DNA była równoległa, wiązanie wodorowe nie byłoby możliwe, ponieważ pary zasad nie byłyby sparowane w znany sposób. Cztery pary zasad to: adenina, guanina, cytozyna i tymina, gdzie adenina uzupełnia tyminę, a guanina uzupełnia cytozynę., Transkrypcja byłaby kolejnym problemem, gdyby struktura DNA była równoległa, bez sensu odczytywanie informacji z DNA. Prowadziłoby to do produkcji nieprawidłowych białek.