Der Nubische Steinbock ist zahlreichen Bedrohungen ausgesetzt, obwohl sie je nach geografischem Standort variieren. Die Konkurrenz mit Vieh und wilden Kamelen stellt eine Bedrohung in Ägypten und Saudi-Arabien dar; und so auch die Konkurrenz mit wachsenden wilden Eselpopulationen im Oman. Die Fluktuation der Verfügbarkeit und Verteilung von Wasserlöchern in Ägypten dürfte auch einen großen Einfluss auf die Steinbockpopulation haben. Habitatverlust und-abbau geben Anlass zur Sorge., Eine hohe Anzahl von Touristen findet man an Bewässerungs -, Fütterungs-und Geburtsorten in Israel, und die Ausweitung von Nebenstraßen, Vieheinfälle und andere Entwicklungsdruck verschlechtern schnell den Lebensraum in Saudi-Arabien innerhalb der verbleibenden Schutzhütten des Steinbocks. Die geringe Größe und Fragmentierung der verbleibenden Steinbockpopulationen ist besorgniserregend, da begrenzte Ausbreitungsmöglichkeiten zu einer verringerten genetischen Vielfalt und verringerten Überlebenschancen führen können. Die Jagd ist eine zusätzliche Bedrohung für die Art in ihrem gesamten Bereich., Im Jemen gehören automatische Waffen vielen Menschen im ganzen Land; Hier stellt die Jagd wahrscheinlich die größte Bedrohung für den Steinbock dar.
1979 wurde in Saudi-Arabien ein generelles Jagdverbot für Steinböcke erlassen, jedoch ist Wilderei in abgelegenen Gebieten nach wie vor schwer zu kontrollieren. Israel ist führend im Schutz des Steinbocks vor der Jagd. Der nubische Steinbock lebt in mehreren Schutzgebieten, darunter zwei saudi-arabische Reservate, die von der National Commission for Wildlife Conservation and Development (NCWCD) eingerichtet wurden, hauptsächlich zum Schutz dieser Art., Das Dana Nature Reserve und das Mujib Reserve in Jordanien halten auch nubische Steinbockpopulationen. Darüber hinaus hat die Royal Society for the Conservation of Nature (RSCN) 1989 ein Zuchtzentrum für in Gefangenschaft gehaltene Tiere im Mujib-Reservat eingerichtet, in dem sich eine erste Gruppe von 22 Steinböcken aus dem San Diego Zoo Safari Park mit über 100 Tieren vermehrt hat. Über 30 dieser Tiere wurden nun erfolgreich in die Wildnis entlassen. Da das Artenspektrum so viele Länder umfasst, ist es schwierig, die gleichen Politiken und Erhaltungsbemühungen überall zu koordinieren., Es ist jedoch unerlässlich, dass zwischen den Ländern kooperative Anstrengungen unternommen werden, um benachbarte Lebensräume zu erhalten und diese Art zu schützen.