Microarray-Teknologi: En introduksjon til DNA Microarray

Referanser >> Microarray

Microarray Technology

Hvordan microarray-teknologi fungerer?

Bakteriell identifikasjon med microarrays

Genet skjøting deteksjon ved hjelp av microarrays

Introduksjon til Microarray

molekylærbiologisk forskning utvikler seg gjennom utvikling av teknologier som brukes for å frakte dem ut., Det er ikke mulig å forske på et stort antall gener ved hjelp av tradisjonelle metoder. DNA Microarray er en slik teknologi som gjør det mulig for forskere å undersøke og løse problemer som en gang var tenkt å være ikke sporbar. Man kan analysere uttrykk av mange gener i en enkelt reaksjon raskt og på en effektiv måte. DNA Microarray-teknologi har muliggjort det vitenskapelige samfunnet til å forstå den grunnleggende aspekter understreker vekst og utvikling i livet, så vel som å utforske den genetiske årsaker til avvik som oppstår i funksjon av menneskekroppen.,

En typisk microarray forsøket innebærer at hybridisering av en mRNA-molekyl til DNA-templat som det er skapt. Mange DNA-prøvene brukes til å konstruere en matrise. Mengden av mRNA bundet til hvert nettsted på tabellen angir uttrykket nivå av ulike gener. Dette nummeret kan kjøre i tusenvis. Alle data er samlet inn og en profil er generert for genuttrykk i cellen.

Microarray Teknikk

En matrise er en ryddig ordning av prøver der matching av kjente og ukjente DNA-prøver er gjort basert på base sammenkobling regler., En rekke eksperiment gjør bruk av felles analyse systemer som microplates eller standard blotting membraner. Prøven spot størrelser er vanligvis mindre enn 200 µm i diameter vanligvis inneholder tusenvis av prikker.

Tusenvis av oppdaget prøver kjent som prober (med kjent identitet) er immobilisert på en solid støtte (et mikroskop glass-slides eller silisium sjetonger eller nylon membran). Stedene kan være DNA, cDNA, eller oligonukleotider. Disse brukes til å fastsette utfyllende binding av ukjente sekvenser slik at parallell analyse for genuttrykk og genet funnet., Et eksperiment med en enkelt DNA-chip kan gi informasjon om tusenvis av gener samtidig. En ryddig ordning av sonder på støtte er viktig som plasseringen av hver flekk på tabellen brukes for identifisering av et gen.

Typer Microarrays

Avhengig av den type som er immobilisert eksempel brukt bygge matriser og informasjonen som er hentet inn, det Microarray eksperimenter kan kategoriseres i tre måter:

1., Microarray Uttrykk Analyse: I denne eksperimentelle oppsett, cDNA avledet fra mRNA av kjente gener er immobilisert. Utvalget har gener fra både normal så vel som den syke vev. Flekker med mer intensitet er innhentet for sykt vev gen om genet er uttrykt over i syk tilstand. Dette uttrykk er deretter sammenlignet med uttrykket mønster av et gen som er ansvarlig for en sykdom.

2. Microarray for Mutasjon Analyse: For denne analysen, forskerne bruke gDNA. Genene kan være forskjellige fra hverandre med så lite som et enkelt nukleotid base.,

En enkelt base forskjellen mellom to sekvenser er kjent som Singel Nukleotid Polymorphism (SNP) og registrerer dem er kjent som SNP gjenkjenning.

3. Komparativ Genomisk Hybridisering: Det er brukt for identifisering i økning eller reduksjon av viktige kromosomale fragmenter husing gener som er involvert i en sykdom.

Programmer av Microarrays

Genet Funnet: DNA Microarray-teknologi bidrar i identifisering av nye gener, vet om deres funksjon og uttrykk nivåer under ulike forhold.,

Sykdom Diagnose: DNA Microarray-teknologi bidrar til å forskerne lærer mer om forskjellige sykdommer som hjerte-og karsykdommer, psykiske lidelser, smittsomme sykdommer og spesielt studiet av kreft. Inntil nylig, ulike typer kreft har blitt klassifisert på grunnlag av de organer som svulster utvikler. Nå, med utviklingen av microarray-teknologi, vil det være mulig for forskerne å ytterligere klassifisere typer kreft på grunnlag av mønstre av genet aktivitet i tumor celler., Dette vil enormt hjelpe den farmasøytiske industrien til å utvikle mer effektive medisiner som behandling strategier vil være rettet direkte til den spesifikke typen av kreft.

Drug Discovery: Microarray-teknologi har omfattende program i Pharmacogenomics. Pharmacogenomics er studiet av sammenhenger mellom terapeutiske reaksjoner på medikamenter, og det genetiske profiler av pasienter. Komparativ analyse av gener fra en syk og en normal celle vil bidra til identifisering av den biokjemiske grunnloven av proteiner syntetiseres av den syke gener., Forskerne kan bruke denne informasjonen til å syntetisere legemidler som kamp med disse proteinene og redusere deres effekt.

Toksikologiske Undersøkelser: Microarray-teknologi gir en robust plattform for forskning på virkningene av giftstoffer på celler og deres passerer videre til avkom. Toxicogenomics etablerer korrelasjon mellom svarene til miljøgifter og endringer i den genetiske profiler av celler som er utsatt for slike miljøgifter.

GEO

I den siste tiden, microarray-teknologi har vært mye brukt av det vitenskapelige samfunnet., Derfor, over år, det har vært en del av generasjon av data relatert til genuttrykk. Denne informasjonen er spredt og ikke lett tilgjengelig for offentlig bruk. For lettelser tilgangen til disse dataene, National Center for Bioteknologi Information (NCBI) har formulert det genuttrykk Omnibus eller GEO. Det er et dataregister anlegget som inkluderer data på genuttrykk fra varierte kilder.,v id=»0052483fe5″>

Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length Probe Length tolerance Probe Target Tm Probe Tm Tolerance (+) Hårnål Maks ÄG Selv Dimer ÄG Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length Probe Length tolerance Probe Target Tm Probe Tm Tolerance (+) Hårnål Maks ÄG Selv Dimer ÄG