Referanser >> Genet Skjøting
Genet Skjøting Oversikt & Teknikker
– Genet Skjøting Innledning
Genet skjøting er en post-transcriptional endring i hvor et enkelt gen kan kode for flere proteiner. Genet Skjøting gjøres i eukaryotes, før mRNA oversettelse, av differensial inkludering eller ekskludering av regionene i pre-mRNA. Genet skjøting er en viktig kilde til protein mangfold., I løpet av en typisk genet skjøting av hendelsen, pre-mRNA transkribert fra ett gen kan føre til ulike modne mRNA-molekyler som genererer flere funksjonelle proteiner. Dermed gene skjøting gjør det mulig for en enkelt gen til å øke sin koding kapasitet, slik at syntesen av protein isoforms som er strukturelt og funksjonelt atskilte. Genet skjøting er observert i høy andel av gener. I humane celler, ca 40-60% av genene er kjent for å ha alternativ spleising.,
– Genet Skjøting Mekanisme
Det finnes flere typer av felles gen skjøting av hendelser. Dette er hendelser som kan samtidig oppstår i genene etter mRNA er dannet fra transkripsjon trinn av det sentrale dogmet i molekylær biologi.
Ekson å Hoppe over: Dette er den vanligste kjente gen skjøting mekanisme som ekson(s) er inkludert eller ekskludert fra den endelige genutrykk fører til forlenget eller forkortet mRNA-varianter., Den exons er den kodende regioner av et gen, og er ansvarlig for å produsere proteiner som er benyttet i ulike celletyper for en rekke funksjoner.
Intron Oppbevaring: En hendelse der et intron er beholdt i den endelige transkripsjonen. I mennesker 2-5 % av gener har blitt rapportert å beholde introns. Genet skjøting mekanisme beholder ikke-kodende (useriøs) deler av genet, og som fører til en demornity i protein struktur og funksjonalitet.
Alternativ 3′ Skjøte Stedet og 5′ Skjøte Webområde: Alternativ genet skjøting inkluderer å bli med på forskjellige 5′ og 3′ skjøte nettstedet., I denne typen av genet skjøting, to eller flere alternativ 5′ skjøte nettstedet konkurrere om å bli med til to eller flere alternativ 3′ skjøte nettstedet.
Skjøte Variant Oppdagelse Metoder
Genet skjøting fører til syntese av ulike proteiner som spiller en viktig rolle i menneskets fysiologi og sykdom. I dag, er den mest effektive metoder for storskala påvisning av skjøte varianter inkluderer computational prediksjon metoder og microarray analyse. Microarray basert skjøte variant gjenkjenning er den mest populære metoden i bruk., Den svært parallelle og sensitive natur microarrays gjør dem ideelle for overvåking av genuttrykk på en vev-spesifikke, genome-wide nivå. Microarray baserte metoder for påvisning av skjøte varianter gir en robust, skalerbar plattform for høy gjennomstrømning oppdagelsen av alternative genet skjøting. En rekke roman gensekvenser som ble oppdaget ved hjelp av microarray baserte metoder som ikke ble oppdaget av ESTs ved hjelp av beregningsmetoder. En annen ofte brukt metode for å oppdage av nye genet isoforms er RT-PCR etterfulgt av sekvensering., Dette er en kraftig tilnærming og effektivt kan brukes for å analysere et lite antall gener. Men, det bare gir bare en begrenset visning av genet struktur, er arbeidskrevende, og ikke lett skaleres til tusenvis av gener eller hundrevis av vev.
Utfordringer i Microarray Design for Skjøte Variant Deteksjon
Microarray basert genet skjøting deteksjon utgjør noen spesielle utfordringer i å utforme prober for isoforms som viser en høy grad av homologi., For å skille mellom disse isoforms, en microarray som bruker en kombinasjon av prober for exons og ekson-ekson veikryss er brukt. Ekson hoppe over hendelser eller andre slettinger kan overvåkes ved hjelp av kryss-prober. For eksempel, en sonde som spenner over ekson 1 og ekson 3 av genet vil oppdage at det å hoppe av ekson 2 fra genet som er oversatt til et protein.
Programvare for å Designe Skjøte Variant Microarrays
AlleleID® automatisk design junction prober samt intra-ekson-prober., Med AlleleID® kan du lage en hvilken som helst kombinasjon av prober for å oppdage alle typer alternativ spleising event.