prosedyren for en funksjonell MR er svært lik som i en vanlig MR-undersøkelse. Pasienten ligger med billedsiden opp på et flatt underlag og er rullet inn i en lang rørformede maskinen. Prosessen er smertefri, men noen mennesker kan føle klaustrofobisk eller bli plaget av høye lyder maskinen gjør under søk.
Inne i skanneren, pasienter er gitt instruksjoner som vises digitalt inne et par briller—lik en virtual reality (VR) – headset., Oppgavene er enkle, slik klemme venstre hånd eller tenker på enkelte ord. Den funksjonelle regioner av hjernen som lyser opp i skanneren er da kombinert med vanlig MR-avbildning av pasientens hjernens anatomi. «Når vi kartlegge de grunnleggende funksjonene, kan vi hjelpe kirurger finne en trygg tilnærming for å fjerne en lesjon eller svulst fra hjernen, eller for kirurgi for epilepsi pasienter,» Dr. Zucconi sier.
Den viktigste forskjellen mellom de to prosedyrene er at i løpet av en fMRI, leger gi pasienten anvisningene og be ham eller henne til å fullføre stille hjernen øvelser mens du ligger stille.,
øvelser øke aktivitet i bestemte deler av hjernen, øke blodstrøm og oksygen til dem. Denne aktiviteten lyser opp på bilder som er opprettet av den skanner, som gir leger et synlig oppføring av et nøyaktig kart over pasientens hjerne.
En normal MR av hjernen kan vare mellom 20 og 30 minutter, mens fMRI varer mellom 40 til 55 minutter.