nukleinsyre molekylene har en phosphoryl (5′) end og en hydroksyl (3′) end. Denne notasjonen følger av organisk kjemi nomenklatur, og kan brukes til å definere bevegelse av enzymer som for eksempel DNA-polymerases i forhold til DNA-strand i en ikke-tilfeldig måte.
G-quadruplexesEdit
De forskjellige typer av topologier i G-quadruplex, propell, sideveis, og diagonal.,
G-quadruplexes, også kjent som G4 DNA er sekundære strukturer som finnes i nukleinsyrer, som er rik på guanin. Disse strukturene er normalt ligger på telomeres (endene av kromosomene). G-quadruplex kan enten være parallelle eller antiparallel avhengig av loop-konfigurasjon, som er en del av strukturen. Hvis alle DNA-tråder som kjører i samme retning, det er kalt til å være en parallell quadruplex, og er kjent som et strand-tilbakeføring/propell, koble tilstøtende parallelle., Hvis ett eller flere av DNA-tråder som kjører i motsatt retning, det er betegnet som en anti-parallell quadruplex, og kan enten være i form av en lateral/edgewise, koble tilstøtende anti-parallelle, eller en diagonal, delta i to diagonalt motsatt tråder. Strukturen i disse G-quadruplexes kan avgjøres av en kasjon.
DNA replicationEdit
I DNA, 5′ carbon er plassert på toppen av de ledende strand, og 3′ carbon er plassert på den nedre delen av lagging strand., Den nukleinsyre sekvenser er komplementære, og parallelt, men de går i motsatte retninger, derav antiparallel betegnelsen. Den antiparallel struktur av DNA er viktig i DNA-replikasjon fordi det etterligner ledende strand den ene veien og lagging strand den andre veien. Under DNA replikasjon, den ledende strand er replikert kontinuerlig mens lagging strand er replikert i segmenter kjent som Okazaki-fragmenter.,
Anti-parallellitet i biochemistryEdit
viktigheten av en antiparallel DNA-dobbel helix struktur er på grunn av sin hydrogenbinding mellom komplementære nitrogenholdige base-par. Hvis DNA-strukturen skulle være parallelle, hydrogen binding ville ikke det være mulig, som base par ville ikke være sammenkoblet i kjent måte. De fire base parene er: adenine, guanin, cytosine, og innhold av tymin, hvor adenine utfyller innhold av tymin og guanin utfyller cytosine., Transkripsjon ville være et annet problem hvis DNA-strukturen skulle være parallelle, noe som gjør ingen følelse av den informasjonen som blir lest fra DNA. Dette vil videre føre til produksjon av feil proteiner.