Lo stambecco nubiano affronta numerose minacce, anche se variano a seconda della posizione geografica. La competizione con il bestiame e i cammelli selvatici rappresenta una minaccia in Egitto e in Arabia Saudita; e così fa la competizione con l’espansione delle popolazioni di asini selvatici in Oman. La fluttuazione nella disponibilità e nella distribuzione delle pozze d’acqua in Egitto è anche probabile che sia una grande influenza sulle popolazioni di stambecchi. La perdita e il degrado dell’habitat sono motivo di preoccupazione., Un elevato numero di turisti si trovano in irrigazione, alimentazione, e siti di parto all “interno di Israele, e l” estensione delle strade secondarie, invasione del bestiame, e altre pressioni di sviluppo stanno rapidamente degradando habitat in Arabia Saudita, all ” interno rifugi rimanenti dello stambecco. Le piccole dimensioni e la frammentazione delle popolazioni di stambecchi rimanenti sono preoccupanti, perché limitate opportunità di dispersione possono portare a una ridotta diversità genetica e a una diminuzione delle possibilità di sopravvivenza. La caccia è un’ulteriore minaccia per le specie in tutto il suo areale., In Yemen, le armi automatiche sono di proprietà di molte persone in tutto il paese; questo è dove la caccia rappresenta probabilmente la più grande minaccia per lo stambecco.
Un divieto generale sulla caccia allo stambecco è stato emanato in Arabia Saudita nel 1979, tuttavia il bracconaggio rimane difficile da controllare in aree remote. Israele è leader nella protezione dello stambecco dalla caccia. Lo stambecco nubiano abita in diverse aree protette, tra cui due riserve dell’Arabia Saudita istituite dalla Commissione nazionale per la conservazione e lo sviluppo della fauna selvatica (NCWCD), principalmente per la protezione di questa specie., Anche la Riserva naturale di Dana e la Riserva di Mujib in Giordania ospitano popolazioni di stambecchi nubiani. Inoltre, la Royal Society for the Conservation of Nature (RSCN) ha istituito un centro di allevamento in cattività nella Riserva Mujib nel 1989, dove un gruppo iniziale di 22 stambecchi inviati dal San Diego Zoo Safari Park si è moltiplicato per oltre 100 animali. Oltre 30 di questi animali sono stati rilasciati con successo allo stato selvatico. Poiché l’areale della specie comprende così tanti paesi, è difficile coordinare le stesse politiche e gli stessi sforzi di conservazione in tutto il mondo., Tuttavia, è essenziale che ci sia uno sforzo cooperativo tra i paesi per mantenere i tratti adiacenti di habitat e proteggere questa specie.