Microarray Technology: an introduction to DNA Microarray (Magyar)

References >>Microarray

Microarray Technology

div > hogyan működik a Microarray technológia?

Bakteriális azonosító használata microarrays

génmanipulálás érzékelő segítségével microarrays

Bevezetés a Microarray

Molekuláris Biológiai kutatás alakul át a fejlesztési technológiák szállítására használt őket., A hagyományos módszerekkel nem lehet nagyszámú gént kutatni. A DNS Microarray egy olyan technológia, amely lehetővé teszi a kutatók számára, hogy megvizsgálják és kezeljék azokat a kérdéseket, amelyek egykor nem voltak nyomon követhetők. Sok gén expresszióját egyetlen reakcióban gyorsan és hatékonyan lehet elemezni. A DNS Microarray technológia felhatalmazta a tudományos közösséget, hogy megértse az élet növekedését és fejlődését hangsúlyozó alapvető szempontokat, valamint feltárja az emberi test működésében előforduló anomáliák genetikai okait.,

egy tipikus mikroarray kísérlet magában foglalja egy mRNS molekula hibridizációját a DNS-sablonhoz, amelyből származik. Sok DNS-mintát használnak egy tömb felépítéséhez. A tömb egyes helyeihez kötött mRNS mennyisége jelzi a különböző gének expressziós szintjét. Ez a szám több ezer lehet. Minden adatot összegyűjtünk, és létrehozunk egy profilt a sejt génexpressziójára.

Microarray Technique

egy tömb a minták rendezett elrendezése, ahol az ismert és ismeretlen DNS-minták egyeztetése az alappárosítási szabályok alapján történik., Egy tömb kísérlet használ közös vizsgálati rendszerek, mint a mikroplátok vagy szabványos blotting membránok. A mintadarabok mérete általában kevesebb, mint 200 mikron átmérőjű, általában több ezer foltot tartalmaznak.

Több ezer foltos minta ismert szondák (ismert identitás) immobilizált szilárd támogatást (mikroszkóp üveg diák vagy szilícium chipek vagy nylon membrán). A foltok lehetnek DNS, cDNA vagy oligonukleotidok. Ezeket az ismeretlen szekvenciák komplementer kötődésének meghatározására használják, ezáltal lehetővé téve a génexpresszió és a génfelfedezés párhuzamos elemzését., Egy egyetlen DNS-chipkel végzett kísérlet egyszerre több ezer génről tud információt szolgáltatni. A szondák rendezett elrendezése a tartón fontos, mivel a tömb minden egyes helyének helyét egy gén azonosítására használják.

típusú Mikroarrays

attól függően, hogy a fajta immobilizált minta használt konstrukció tömbök és az információ beolvasott, a Microarray kísérletek lehet kategorizálni három módon:

1., Microarray expressziós elemzés: ebben a kísérleti beállításban az ismert gének mRNS-ből származó cDNA immobilizálódik. A mintának mind a normál, mind a beteg szövetek génjei vannak. A nagyobb intenzitású foltokat a beteg szövetgénhez kapjuk, ha a gén túl expresszálódik a beteg állapotban. Ezt az expressziós mintát ezután összehasonlítjuk egy betegségért felelős gén expressziós mintájával.

2. Microarray mutációs elemzéshez: ehhez az elemzéshez a kutatók gDNA-t használnak. A gének eltérhetnek egymástól, mint kevesebb, mint egy nukleotid bázis.,

a két szekvencia közötti egyetlen báziskülönbséget egyetlen nukleotid polimorfizmusnak (SNP) nevezik, és ezeket detektálni SNP detektációnak nevezik.

3. Összehasonlító genomikus hibridizáció: a betegségben részt vevő géneket hordozó fontos kromoszómális fragmentumok növekedésének vagy csökkenésének azonosítására használják.

Microarrays

Gene Discovery: a DNS Microarray technológia segít az új gének azonosításában, különböző körülmények között ismeri működésüket és expressziós szintjüket.,

Betegségdiagnózis: a DNS Microarray technológia segít a kutatóknak többet megtudni a különböző betegségekről, például szívbetegségekről, mentális betegségekről, fertőző betegségekről, különösen a rák tanulmányozásáról. Egészen a közelmúltig különböző típusú rákokat osztályoztak azon szervek alapján, amelyekben a daganatok kialakulnak. Most, a mikroarray technológia fejlődésével a kutatók a tumorsejtek génaktivitásának mintái alapján tovább osztályozhatják a rák típusait., Ez óriási segítséget nyújt a gyógyszerészeti közösségnek a hatékonyabb gyógyszerek kifejlesztésében, mivel a kezelési stratégiák közvetlenül a rák specifikus típusára irányulnak.

kábítószer-felfedezés: a mikroarray technológia széles körben alkalmazható a Farmakogenomikában. A farmakogenomika a gyógyszerekre adott terápiás válaszok és a betegek genetikai profiljai közötti összefüggések vizsgálata. A beteg és a normális sejt génjeinek összehasonlító elemzése segít a beteg gének által szintetizált fehérjék biokémiai összetételének azonosításában., A kutatók ezt az információt felhasználhatják olyan gyógyszerek szintézisére, amelyek ezekkel a fehérjékkel küzdenek, és csökkentik hatásukat.

toxikológiai kutatás: a Microarray technológia robusztus platformot biztosít a toxinok sejtekre gyakorolt hatásának és az utódokra való továbbadásának kutatására. A toxikogenomika összefüggést állapít meg a toxikánsokra adott válaszok és az ilyen toxikánsoknak kitett sejtek genetikai profiljában bekövetkező változások között.

GEO

a közelmúltban a mikroarray technológiát a tudományos közösség széles körben használta., Következésképpen az évek során sok génexpresszióval kapcsolatos adat jött létre. Ezek az adatok szétszórtak, és nem könnyen elérhetők nyilvános használatra. Ezen adatok hozzáférhetőségének megkönnyítése érdekében a Nemzeti Biotechnológiai Információs Központ (NCBI) megfogalmazta az Omnibus vagy GEO génexpressziót. Ez egy adattároló létesítmény, amely különböző forrásokból származó génexpresszióra vonatkozó adatokat tartalmaz.,v id=”0052483fe5″>

Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length Probe Length tolerance Probe Target Tm Probe Tm Tolerance (+) Hajtű Max ÄG Egyéni Dimer ÄG Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length Probe Length tolerance Probe Target Tm Probe Tm Tolerance (+) Hajtű Max ÄG Egyéni Dimer ÄG