az Arborétum a Rancho Santa Anita, Dél-Kalifornia egyik mexikói földterületének megmaradt részén helyezkedik el. Rancho Santa Anita szokatlan volt abban, hogy a Raymond-medence víztartó rétegének nagy része felett helyezkedik el. A területen három sag-tavat és számos forrást találtak, az egyetlen megmaradt pedig a Baldwin-tó. A San Marino városában található Lacy Park egykor egy másik sag-tó volt, a harmadik pontos helye nem ismert, de a Huntington Könyvtár és a Botanikus Kert területén lehetett., A relatív vízbőség következtében az őskorban fontos terület volt, mint egész évben folyó vízforrás, a Baldwin-tó néven ismert víztest és a többi sag-tó vonzotta mind a vízimadarakat, mind más állatokat, valamint az őslakos amerikaiakat. Nem meglepő, hogy a víz és a vad jelenléte állandó indián lakhelyet hozott létre a térségben, és úgy gondolják, hogy Aleupkigna Tongva faluja volt., A közeli San Gabriel misszió közelsége egy kis szezonális lakás építéséhez vezetett az Arborétum helyén pásztorok vagy vadászok számára, ami végül szerény vályogszerkezet kialakításához vezetett.
1839-ben a Rancho Santa Anitának járó támogatást Hugo Reid (1809-1852) és Tongva felesége, Viktória kapta. Reid 1839-ben épített egy vályogházat a tó mellett, amely most egy kaliforniai történelmi mérföldkő. Reid képzett skót volt, aki a Tongva kultúrát leíró levelek sorozatáról ismert., Egyébként Reid valószínűleg legismertebb szerepe volt az 1849-es kaliforniai alkotmányos Egyezményben. Tuberkulózisban szenved, 43 éves korában halt meg. Az ingatlan rövid távú tulajdonosainak sorozata, Rancho Santa Anita követte.
a későbbi tulajdonosok Rancho Santa Anita voltak; sorrendben Henry Dalton, Joseph A. Rowe, Albert Dibblee együttműködve William Corbett és a Mr. Barker, Leonard Rose és William Wolfskill, Alfred Chapman Harris Newmark, amíg végül az ingatlan eladták Elias Jackson Baldwin., Minden átmenet, kezdve az eladás Rose és Wolfskill, egy részét a ranch eladták. Minden tulajdonos valamilyen módon jellemzi Dél-Kalifornia történelmét az időszak alatt. A mezőgazdasági innováció olyan jellegzetesség, amely továbbra is kihasználta az éghajlatot és az általa lehetővé tett új terményeket, valamint a fogyasztók egyre növekvő körét és a közlekedési innovációk által megnyitott új piacokat.
1875-ben, amikor Elias Jackson “Lucky” Baldwin megvásárolta Rancho Santa Anitát és megépítette épületeit és földjeit., Baldwin befolyását az Oakwood Hotel és a Santa Anita versenypálya kiállításának létrehozásában is megmutatták. Kereskedelmi szőlőtermesztés virágzott szerte a San Gabriel misszió, mivel mission days. Baldwin díjnyertes pincészetet alapított a turisták ellátására, telkeket adott el telepeseknek, valamint magán Vízmű-és téglagyárakat üzemeltetett. A Henry E. Huntingtonnal és a Santa Fe-i vasúttal való partnerség biztosította, hogy az utasok vasúton érkezhessenek Los Angelesből és más helyszínekről, valamint árufuvarozást, például épületkészleteket és hajófarmokat.,
az arborétum 1947-ben kezdődött, Kaliforniában és Los Angelesben közösen 111 hektárt (44,9 hektár) vásároltak, hogy létrehozzanak egy arborétumot a Baldwin-oldal körül. 1949-re megépült az első üvegház, és a telep üzemeit leltárba vették. 1951-ben az első 1000 fát ültették, 1956-ban pedig az arborétumot megnyitották a nyilvánosság számára. Az 1950-es és 1960-as években folyamatos kert-és üvegházépítések zajlottak, 1975-1976-ban pedig megnyílt a trópusi üvegház, és elkészült az őskori és dzsungel Kert. Mind az üvegházak, mind a kertek építése és felújítása folytatódik.,
a talajvíz – feltöltő tavakat és egy szivattyúállomást javasolt a Los Angeles Megyei közművek és az ausztráliai szakasz 4 hektáros (1,6 ha) öt lábas városából álló konzorcium.