Muir először látogatott Yosemite 1868-ban. Annyira lenyűgözte a heti látogatása, hogy úgy döntött, hogy visszatér a következő évben, munkát találni, mint egy ranch kéz, ahogy telepedett a területen. A következő évben, ő leszállt egy pásztor munkát $ 30 havonta, amely megfelel neki finom. Míg Muir egy 2000 juhból álló nyájat vezetett a magas-Sierra Tuolumne-I rétekre, tanulmányozta a növény-és állatvilágot, és felvázolta a hegyi tájat. (Élményeit és illusztrációit később, az első nyári Sierra-I előadásomban publikálták.,) Juhászkutya után Muir rendszeres munkát talált egy újonnan épített fűrésztelepen, a mai alsó Yosemite őszi ösvény mellett a völgyben. A két év alatt dolgozott a malom tulajdonában James Mason Hutchings, Muir kezdett építeni a saját Yosemite Creek kabin, ha csak így tudta hallani a víz hangját, ahogy aludt. Muir újfent kiemelt, mint a Yosemite szóvivője zavarta Hutchings, aki elképzelte magát a végleges hatóság a témában. Fellángoltak a kedélyek, Muir pedig 1871-ben kilépett.,
1871 szeptemberében, két hónappal a fűrésztelep elhagyása után, Muir írta első cikkét a gleccserekről, amelyet a New York Tribune-ban tettek közzé. Az irodalmi, tudományos és művészeti hírességekkel való kapcsolatteremtő képessége gyorsan növelte Muir természettudósi hírnevét. Asa Gray és Albert Kellogg botanikusok, William Kieth művész, Ina Coolbrith költő, Charles Warren Stoddard és Henry George szerkesztők, Jeanne Carr író, J. B. McChesney és John Swett oktatók,valamint J. J. Reilly fotós mind korai bizalmasokká váltak.,
Az 1870-es években a Muir újságkiadásainak népszerűsége folyamatosan nőtt. A termékeny író különösen aggasztotta a természeti táj megőrzését. Megjelent A Sacramento Record-Union 1876-ban, “Isten első templomaiban: hogyan őrizzük meg erdeinket?”chided Kaliforniai törvényhozók készenlétben, míg az állam erdők voltak gondatlanul kimerült. Az 1880-as években a természeti erőforrások megsemmisítésére összpontosította figyelmét az 1864-ben elkülönített állami Yosemite Grant körüli területeken., Muir aggódva a károkat az állatállomány állat okozta, hogy a kényes Magas Sierra ökoszisztémák, különösen a “patás sáskák” volt olyan gondosan őrzött néhány évvel korábban.