csak egy évvel a megalakulása után a Benefis megtámadta a speciális sebészeti központok építését Great Falls-ban. Mind a Montana központi sebészeti központja (egy ambuláns ápolási létesítmény, amelyet 1996-ban alapított a helyi Great Falls üzletember, Harold Poulsen), mind a Great Falls Klinika (egy 1917-ben alapított orvos tulajdonában lévő csoportgyakorlat) bejelentette, hogy járóbeteg-sebészeti központokat kíván építeni a városban. A klinika a Benefis-szel közös vállalkozásként fedezte fel központjának építését, de a COPA-megállapodás megtiltotta., Mindkét vállalat igénylési igazolást (con) kért sebészeti központjaik számára, de a Benefis megtámadta ezeket a bejelentéseket. Mindkét vállalat ezután megváltoztatta terveit, mondván, hogy helyette speciális sebészeti központokat építenek (mivel az állami törvény szerint engedélyre nem volt szükség). Az állam ezt követően mindkét tervet jóváhagyta. Benefis keresetet nyújtott be az állami kerületi bíróság, valamint nyújtott be tiltakozást az állam a döntés, hogy ne kérjen igazolást a szükségességét sem javasolt létesítmény.,
1997. December végén Benefis, a Montana központi Sebészeti Központ és a Great Falls Klinika megállapodtak abban, hogy peren kívül rendezik nézeteltéréseiket, és megszüntetik a Montana állammal fennálló közigazgatási vitájukat. A Central Montana Sebészeti Központ és a Great Falls Klinika megállapodtak abban, hogy felhagynak a sebészeti kórházak építésének terveivel, és helyette járóbeteg-sebészeti központokat építenek. A Benefis vállalta, hogy bezárja saját ambuláns sebészeti központját, és 49 százalékos tulajdonos lesz a klinika központjában., A Montana államügyészi hivatal, amely jóváhagyta a település, mondta Benefis lenne megengedett, hogy felszámolja a költségek bezárása központja a $ 86 millió költségmegtakarítás tartozott a közösség.
A Benefis 7 millió dolláros többletbevételt jelentett 1997-ben 140 millió dolláros bevételre. 1999 elején a Benefis bejelentette, hogy súlyos pénzügyi veszteségeket szenved, amelyek veszélyeztetik az egészségügyi ellátás képességét., 1999 januárjában a vállalat 1998-ban 128 millió dolláros bevételkiesésről számolt be, és 1999-ben ennek a veszteségnek a dupláját vetítette előre, a bevételek jelentős növekedése nélkül. A Benefis azt állította, hogy COPA-megállapodása nem számolt a Columbus és a Deaconess kórházak egyesülésének költségeivel, és nem rendelkezett a megállapodás kiigazításáról abban az esetben, ha a verseny az üzleti tervének megváltoztatását kényszerítette ki. A vállalat 17 millió dollárral csökkentette a költségeket, az építési költségek 17 millió dollárral nőttek, és még nem hajtottak végre létszámcsökkentést. Benefis várható veszteségek összesen $ 25.,7 millió 2003-ig, hacsak nem történt változás a COPA-ban. Két hónapos tárgyalások után az állam módosította a COPA-t, hogy a Benefis az eredetileg megengedettnél gyorsabban emelhesse az árakat (12 millió dollár bevételt generálva), és 39,5 millió dollárral csökkentse a Közösségbe visszajuttatott Költségmegtakarításokat. A COPA futamideje (kezdeti feltételei 2006-ban fejeződtek be) nem változott.
2000 januárjában a Benefis arról számolt be, hogy a változások miatt 1999-ben 9, 1 millió dollár többletbevételt generált. A Társaság 2 millió dollárról 4 dollárra megduplázta jótékonysági ellátási kiadásait.,8 millió, a fekvőbetegek árai 6 százalékkal alacsonyabbak voltak az egyesülés előtti áraknál, a járóbeteg-ellátás árai pedig 15 százalékkal alacsonyabbak voltak az egyesülés előtti áraknál. Ugyanebben az évben a Benefis 7 millió dolláros ajándékot kapott egy névtelen adományozók csoportjától, amely lehetővé teszi, hogy egy 25,000 négyzetméteres (2,300 m2) hospice-t (ma Peace Hospice néven ismert) építsen keleti campusa közelében. 2000 augusztusában a Benefis megállapodást írt alá a Treasure State Healthcare Network-szel, egy független gyakorlati szövetséggel (IPA), amely a Great Falls-ban gyakorló orvosok mintegy 30% – át képviseli., A megállapodás 50-50 for-profit partnerséget hozott létre, amely a Benefis-t és az IPA-t forgalmazta a nagy munkaadóknak és az egészségügyi alapoknak.
a változások ellenére a Benefis folyamatos pénzügyi nyomással szembesült. A Társaság 2000-ben 3, 3 millió dolláros többletbevételt ért el, de azt mondta, hogy csak 2001-ben fog megtörni. A COPA-megállapodás második felülvizsgálatát kérte, de az állam megtagadta a feltételek újbóli megnyitását.
2001 – ben a Benefis ismét állami engedélyt kért a COPA feltételeinek felülvizsgálatára., Abban az évben Harold Poulsen, a Central Montana Surgery Center tulajdonosa bejelentette, hogy épít egy 20 ágyas, 24,000 négyzetméteres (2,200 m2), 5.3 millió dolláros fekvőbeteg speciális sebészeti kórházat (amelyet Central Montana sebészeti kórháznak hívnak). (Ehelyett Poulsen végül átalakította meglévő járóbeteg-központját kórházba.) A Benefis még Poulsen bejelentése előtt megpróbálta újraindítani a COPA-t, de a versenytárs terveinek bejelentése után egyre sürgetőbbé vált. De még egyszer az állam elutasította a kérelmet.
2005 októberében a Benefis arra törekedett, hogy elégedetlen legyen a Gondviselési szolgáltatásokkal., Vita között a helyi egészségügyi rendszer, illetve a szülői szervezet először merült fel 2003-ban, amikor a Gondviselés Szolgáltatások kérdezte Benefis változtatni a vállalati alkotmány, illetve a törvények lehetővé a szülői szervezet megvétózni közös vállalat, hogy a helyi rendszer be, felülvizsgálatát, valamint a vétó tőke kiadási tervek, valamint a hatalmat, hogy elutasít minden olyan vezérigazgató a rendszer megpróbálja felvenni. Benefis visszautasította, és 2004-ben a Providence Services elutasította egy olyan vállalati kötvény kibocsátását, amely finanszírozta volna egy új rákközpont építését Great Fallsban., A standard & Poor’ s, a bond rating agency szerint a Benefis a Providence Services teljes eszközeinek 16 százalékát, működési bevételeinek 17 százalékát, nettó működési bevételeinek 30 százalékát járult hozzá. 2005 decemberének utolsó hetében a Benefis megnyitotta 20 millió dolláros Sletten Cancer Institute-ját.
2006 elején Benefis arra törekedett, hogy megakadályozza a Great Falls klinikát a 20 ágyas Montana központi sebészeti kórház megvásárlásában., A klinika együttműködött az Essentia Health-szel, egy Minnesotai és Észak-Dakotai székhelyű nonprofit egészségügyi rendszerrel, hogy megvásárolja Harold Poulsen kiemelkedő készletét a Montana központi sebészeti kórházban, és ellenőrző részesedést szerezzen a sebészeti kórházban. Benefis beperelte, hogy megakadályozzák a tranzakció, azzal érvelve, hogy az új tulajdonosok célja, hogy fut a létesítmény, mint egy különleges kórházba megsértésével egy 2005-ös törvény tiltó további építési ilyen típusú létesítmények, valamint, hogy a Klinikán Essentia nem alkalmazható a szükséges egészségügyi intézmény engedélyét., Az egészségügyi rendszer ideiglenes távoltartási végzést nyert. Benefis azt is mondta, hogy évente 4 millió dollárt veszít a bevételekből, ha a Montana központi sebészeti kórházát általános kórházként engedélyezték. A cég szerint valószínűleg bezárja renális dialízis részlegét, felfüggeszti az Irgalmassági járatokat, bezárja az idősek otthonát, és véget vet a járóbeteg-és Vegyészeti szakellátásnak. Benefis azt is mondta, hogy évente több millió dollárt veszít a szövetségi kifizetésekben is. Március 24-én a végzést megszüntették., Benefis három nappal később sürgősségi indítványt nyújtott be a Montana Legfelsőbb Bírósághoz, fellebbezve a kerületi bíróság döntését. Montana állam ezután hat hónapos ideiglenes engedélyt adott ki Montana központjában, hogy általános kórházként működjön. De október 4, 2006, a Montana Legfelsőbb Bíróság úgy döntött, 4-to-3, hogy fenntartsák a kerületi bíróság elbocsátás az ideiglenes végzés. Az állami legfelsőbb bíróság azonban elutasította a Benefis perében felvetett egyéb kérdések eldöntését, és nyitva hagyta az ajtót, hogy a Társaság folytassa a kerületi bíróságokon folytatott peres eljárásokat., 2006.November 6-án Benefis elutasította a legfelsőbb bíróság határozatának fellebbezését, és azt mondta, hogy a többi kérdést nem hozza vissza a kerületi bírósághoz. 2007 februárjában a klinika beperelte a Benefis-t a jogi díjak behajtására. Egy állami bíró 2007 szeptemberében úgy döntött, hogy a Benefisnek meg kell fizetnie ezeket a díjakat.
szintén 2006-ban a klinika megvásárolta a Benefis 49 százalékos tulajdonát A Great Falls Clinic Surgery Centerben.
a Benefis 2006-ban számos építési projektet is indított., Egy 80.000 négyzetméteres (7.400 m2), háromemeletes, 14 millió dolláros orvosi irodaépületen és a régi Deaconess épület 22 privát szobáján kezdett el dolgozni, 4 millió dolláros költséggel. A Benefis a rehabilitációs és fizikoterápiás egységeit is egy helyre konszolidálta keleti campusán, és szakképzett ápolói egységét a nyugati campusba helyezte át. Áthelyezte a Montana ortopédiai, neurológiai és Rehabilitációs Központ (MONARC) sportsérülési központját és viselkedési egészségügyi egységét a régi ápolási otthon terébe, kibővítette sürgősségi váróterét, és átalakította gyermekgyógyászati egységét., 2006 januárjában a Benefis változatos klinikai szolgáltatásokkal társult a Benefis sebe Care and Hyperbaric Medicine Center megnyitásához,amely akkoriban csak Montana államban volt ilyen. 2006 augusztusában, Benefis’ Sletten Cancer Institute ki a CyberKnife nukleáris sugársebészeti rendszer kezelésére daganatok, illetve más egészségügyi feltételek (abban az időben, hogy Benefis az egyetlen kórház, hogy a saját cyberknife a Idaho, Montana, Oregon, Washington, valamint Wyoming területek).
Benefis 2006.szeptember 30-án véglegesítette a Providence Services-től való elválasztását., Benefis kénytelen volt 10 millió dolláros adományt adni a goodwill fedezésére, és visszafizetni a Providence Services által a társaságnak nyújtott kölcsönöket. Mind a Vatikán, mind a montanai főügyész Hivatala jóváhagyta a elégedetlenséget. A vállalat azt mondta, hogy havonta 100,000 dollárt takarított meg a vállalati rezsiköltségekben, bár ugyanolyan költséggel járt, mert most magasabb kamatfizetések voltak az adósságán., Ugyanebben az évben a Benefis megalapította a Northcentral Montana Healthcare Alliance-t, egy 14 kórházból és hosszú távú gondozási létesítményekből álló konzorciumot, amelynek célja a tagintézmények általános gazdasági jólétének előmozdítása volt. Benefis is adott Cascade County 3.5 Hold (1.4 ha) közelében Benefis Court cserébe 2.6 Hold (1.1 ha) földterület közelében 15th Avenue South 25th Street szeptemberben 2006., Egy hónappal később, az Egyesült Államok Mezőgazdasági minisztériuma Vidékfejlesztési támogatási program elnyerte $380,000, hogy Northcentral Montana Egészségügyi Szövetség bővíteni telehealth egészében a területalapú támogatást, amely párosul egy $700,000 támogatás Benefis.
2007. február 7-én egy Benefis Mercy Flight Beechcraft Super King Air 200 kétmotoros, rögzített szárnyú repülőgép lezuhant egy rövid távolságra a Gallatin Field repülőtértől (Bozeman közelében, Montana) 9 óra körül, megölve a pilótát, egy regisztrált ápolót és egy mentőt., Az áldozatok családtagjai azzal érveltek, hogy a repülést Üzemeltető vállalkozó, a Metro Aviation nem tartotta be a biztonsági és képzési eljárásokat. 2007 júniusában a Metro Aviation bizalmas, bíróságon kívüli megállapodást kötött Paul Erickson mentős családjával. 2009 áprilisában Darcy Dengel nővér családja peren kívüli megállapodást kötött a Metro Aviation-vel.
2007 márciusában a Benefis és a Great Falls Klinika megkezdte a szívgondozásban való együttműködés módjainak feltárását., Ezek a tárgyalások két évig folytatódtak, és olyan megbeszélésekre is kiterjedtek, amelyekben a Benefis egyenesen megvásárolta a klinikát. Bár a tárgyalások 2010 februárjában folytatódtak, a klinika végül elutasította a Benefis által kínált bizalmas vételárat és feltételeket.
2008-ban a Benefis még tovább bővült. Augusztusban nyitotta meg új Hi-Line Sletten Rákközpontját Havre-ban., Ugyanebben a hónapban együttműködött a 10-orvos Great Falls ortopéd társaival, hogy lebontják a 17 millió dolláros, 72,000 négyzetméteres (6,700 m2) ortopédiai központot Montana, egy ambuláns és járóbeteg sebészeti központot, amely fizikoterápiát, sportgyógyászatot és sürgősségi ellátást kínál. Az új épület megengedte a Benefis Quick Care-nak, egy meglévő sürgősségi ellátó központnak, hogy az egészségügyi rendszer nyugati campusán nagyobb negyedekbe költözzön., Decemberben, Benefis kezdett építési, költség, marketing tanulmányok célja az épület egy folyamatos eset nyugdíjas közösség 60 hektáros (24 ha) délre keleti campus. A projekt első szakasza (amely az 1980-as évek elején épült hagyományos ápolási otthon helyébe lépne) négy év alatt több hét-10 fős házat építene, hogy hosszú távú ápolási ellátást, étkezési lehetőségeket és kikapcsolódást biztosítson. A cég azt mondta, hogy önálló és segítőkész létesítményeket is kíván építeni. A projekt első fázisában 2010 novemberében megszakadt a talaj.,
2009-Ben a Republikánus Képviselő Denny Rehberg biztosított szövetségi kiadások különít el a Benefis, amely tartalmazza $300,000 támogatni építése a gyermekgyógyászati ellátás területeken, $900,000 a kardiológiai ellátás lakosztályok az új torony, valamint a $143,000 az elektronikus egészségügyi nyilvántartás, majd mint eddig valaha.
a Benefis 2010 augusztusában kezdte meg egy 17 millió dolláros, négyemeletes, 79 000 négyzetméteres (7300 m2) orvosi irodaépület építését Montana ortopédiai központja mellett, keleti campusán., Az épület a Benefis Medical Group (korábbi nevén Benefis Doctor Associates), egy 53 orvosból és 18 egyéb egészségügyi szolgáltatóból álló csoport, a 2007 végén létrehozott egészségügyi rendszer otthona volt. Ez év szeptemberében orvosi nyilvántartási funkcióit a Pennsylvaniai Precyse-re, egy orvosi nyilvántartási átírásra, kódolásra és bejelentő cégre is kiszervezte.
2011 áprilisában a Benefis bejelentette, hogy 5, 5 millió dolláros, 40 egységnyi alacsony jövedelmű lakhatási projektet épít az idősek számára., Az Egészségügyi Társaság lakásadó-jóváírásokat kért a Montana lakhatási tanácsától a projekthez (1996 óta csak harmadik alkalommal, hogy ilyen hiteleket kerestek egy Great Falls-i projekthez). Benefis szerint a Mountain Plains Equity group of Billings is befektetne a projektbe, amelyet 3 hektáron (1.2 ha) építenek a meglévő 66 hektáros (27 ha) senior campus mellett (akkoriban építés alatt). A projekt, amelyet a Benefis Grandview – nak hívnak, 2011 őszén lebontaná a terepet., Benefis elmondta azt is, hogy a 2010 novemberében megkezdett hosszú távú ápolási és lakhatási támogatás költsége mintegy 21,5 millió dollár lesz. A független lakóingatlanok költségeit még nem határozták meg, de 2012-ben lebontják. Ez a második szakasz, Benefis mondta, most magában foglalja 33 önálló otthonok is.
a Benefis 2011 áprilisában azt is elmondta, hogy 3,5 millió dollárt költene Csúcsegészségügyének bővítésére és felújítására & Wellness facility, A for-profit közös vállalat magánbefektetőkkel.