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aperçu de L’épissage des gènes & Techniques
introduction de L’épissage des gènes
L’épissage de gènes est une modification post-transcriptionnelle dans laquelle un seul gène peut coder plusieurs protéines. L’épissage des gènes se fait chez les eucaryotes, avant la traduction de l’ARNm, par l’inclusion ou l’exclusion différentielle de régions de pré-ARNm. L’épissage des gènes est une source importante de diversité protéique., Au cours d’un événement typique d’épissage de gènes, le pré-ARNm transcrit à partir d’un gène peut conduire à différentes molécules d’ARNm matures qui génèrent plusieurs protéines fonctionnelles. Ainsi, l’épissage de gènes permet à un seul gène d’augmenter sa capacité de codage, permettant la synthèse d’isoformes protéiques distinctes structurellement et fonctionnellement. L’épissage des gènes est observé dans une proportion élevée de gènes. Dans les cellules humaines, environ 40 à 60% des gènes sont connus pour présenter une épissure alternative.,
l’Épissage des Gènes Mécanisme
Il existe plusieurs types de communes du gène événements d’épissage. Ce sont les événements qui peuvent se produire simultanément dans les gènes après la formation de l’ARNm à partir de l’étape de transcription du dogme central de la biologie moléculaire.
saut D’Exon: c’est le mécanisme d’épissage de gène connu le plus courant dans lequel des exons sont inclus ou exclus de la transcription génique finale conduisant à des variantes d’ARNm étendues ou raccourcies., Les exons sont les régions codantes d’un gène et sont responsables de la production de protéines qui sont utilisées dans divers types de cellules pour un certain nombre de fonctions.
rétention D’Intron: un événement dans lequel un intron est conservé dans la transcription finale. Chez l’Homme, 2 à 5% des gènes ont été signalés pour retenir les introns. Le mécanisme d’épissage des gènes retient les parties non codantes (indésirables) du gène et entraîne une démornité dans la structure et la fonctionnalité des protéines.
site D’épissure alternatif 3′ et Site d’épissure 5′: L’épissure alternative de gènes comprend la jonction de différents sites d’épissure 5′ et 3′., Dans ce genre d’épissure de gène, deux ou plusieurs sites alternatifs d’épissure de 5′ rivalisent pour se joindre à deux ou plusieurs sites alternatifs d’épissure de 3′.
méthodes de détection des variantes D’épissure
L’épissure génique conduit à la synthèse de protéines alternatives qui jouent un rôle important dans la physiologie humaine et la maladie. Actuellement, les méthodes les plus efficaces pour la détection à grande échelle des variantes d’épissure comprennent les méthodes de prédiction de calcul et l’analyse de microréseaux. La détection des variantes d’épissure à base de puces est la méthode la plus populaire actuellement utilisée., La nature hautement parallèle et sensible des microréseaux les rend idéales pour surveiller l’expression des gènes à un niveau spécifique aux tissus et à l’échelle du génome. Les méthodes basées sur des puces pour détecter des variantes d’épissure fournissent une plate-forme robuste et évolutive pour la découverte à haut débit d’épissure de gène alternative. Un certain nombre de nouvelles transcriptions de gènes ont été détectées à l’aide de méthodes basées sur des microréseaux qui n’ont pas été détectées par les est à l’aide de méthodes de calcul. Une autre méthode couramment utilisée pour découvrir de nouvelles isoformes génétiques est la RT-PCR suivie d’un séquençage., Il s’agit d’une approche puissante qui peut être utilisée efficacement pour analyser un petit nombre de gènes. Cependant, il ne fournit qu’une vue limitée de la structure des gènes, nécessite beaucoup de travail et ne s’adapte pas facilement à des milliers de gènes ou à des centaines de tissus.
défis dans la conception de microréseaux pour la détection de variantes D’épissure
la détection D’épissures géniques à base de microréseaux pose des défis uniques dans la conception de sondes pour les isoformes qui montrent un haut degré d’homologie., Afin de différencier ces isoformes, une puce qui utilise une combinaison de sondes pour les exons et les jonctions exon-exon est utilisée. Les événements de saut d’Exon ou d’autres suppressions peuvent être surveillés à l’aide de sondes de jonction. Par exemple, une sonde couvrant l’exon 1 et l’exon 3 du gène permettra de détecter le saut de l’exon 2 du gène qui est traduit en une protéine.
logiciel de conception de microréseaux de variantes D’épissures
AlleleID® conçoit automatiquement des sondes de jonction ainsi que des sondes intra-exon., Avec AlleleID®, vous pouvez concevoir n’importe quelle combinaison de sondes pour détecter n’importe quel type d’événement d’épissage alternatif.