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Technologie des puces

Comment la technologie des puces travaux?

identification Bactérienne à l’aide de puces
l’épissage des Gènes de détection à l’aide de puces

Introduction des puces

la recherche en Biologie Moléculaire évolue à travers le développement des technologies utilisées pour leur réalisation., Il n’est pas possible de faire des recherches sur un grand nombre de gènes en utilisant des méthodes traditionnelles. Les puces à ADN sont une de ces technologies qui permet aux chercheurs d’étudier et de résoudre des problèmes qui étaient autrefois considérés comme non traçables. On peut analyser l’expression de nombreux gènes en une seule réaction rapidement et de manière efficace. La technologie des puces à ADN a permis à la communauté scientifique de comprendre les aspects fondamentaux de la croissance et du développement de la vie ainsi que d’explorer les causes génétiques des anomalies survenant dans le fonctionnement du corps humain.,

Une expérience typique de microréseau implique l’hybridation d’une molécule d’ARNm au modèle D’ADN dont elle est issue. De nombreux échantillons D’ADN sont utilisés pour construire un tableau. La quantité d’ARNm liée à chaque site du réseau indique le niveau d’expression des différents gènes. Ce nombre peut courir en milliers. Toutes les données sont collectées et un profil est généré pour l’expression des gènes dans la cellule.

technique de microréseau

un réseau est un arrangement ordonné d’échantillons où l’appariement d’échantillons d’ADN connus et inconnus est effectué sur la base de règles d’appariement de base., Une expérience en réseau utilise des systèmes d’analyse courants tels que des microplaques ou des membranes buvables standard. Les tailles de tache d’échantillon sont typiquement moins de 200 microns de diamètre contiennent habituellement des milliers de taches.

des milliers d’échantillons tachetés connus sous le nom de sondes (avec une identité connue) sont immobilisés sur un support solide (des lames de verre de microscope ou des puces de silicium ou une membrane de nylon). Les taches peuvent être de L’ADN, de l’ADNc ou des oligonucléotides. Ceux-ci sont utilisés pour déterminer la liaison complémentaire des séquences inconnues permettant ainsi une analyse parallèle pour l’expression et la découverte de gènes., Une expérience avec une seule puce à ADN peut fournir des informations sur des milliers de gènes simultanément. Une disposition ordonnée des sondes sur le support est importante car l’emplacement de chaque point sur le réseau est utilisé pour l’identification d’un gène.

Types de microréseaux

en fonction du type d’échantillon immobilisé utilisé et des informations récupérées, les expériences de microréseaux peuvent être classées de trois manières:

1., Analyse de L’Expression des microréseaux: dans cette configuration expérimentale, l’ADNc dérivé de l’ARNm de gènes connus est immobilisé. L’échantillon contient des gènes provenant à la fois des tissus normaux et des tissus malades. Des taches plus intenses sont obtenues pour le gène du tissu malade si le gène est surexprimé dans l’état malade. Ce modèle d’expression est ensuite comparé au modèle d’expression d’un gène responsable d’une maladie.

2. Microréseau pour L’analyse des mutations: pour cette analyse, les chercheurs utilisent gDNA. Les gènes peuvent différer les uns des autres d’autant moins qu’une seule base nucléotidique.,

Une seule différence de base entre deux séquences est connue sous le nom de polymorphisme nucléotidique unique (SNP) et leur détection est connue sous le nom de détection SNP.

3. Hybridation génomique Comparative: il est utilisé pour l’identification dans l’augmentation ou la diminution des fragments chromosomiques importants abritant des gènes impliqués dans une maladie.

Applications des puces à ADN

découverte de gènes: la technologie des puces à ADN aide à identifier de nouveaux gènes, à connaître leur fonctionnement et leurs niveaux d’expression dans différentes conditions.,

diagnostic de la maladie: la technologie des puces à ADN aide les chercheurs à en apprendre davantage sur différentes maladies telles que les maladies cardiaques, les maladies mentales, les maladies infectieuses et surtout l’étude du cancer. Jusqu’à récemment, différents types de cancer ont été classés sur la base des organes dans lesquels les tumeurs se développent. Maintenant, avec l’évolution de la technologie des puces à puces, il sera possible pour les chercheurs de classer davantage les types de cancer sur la base des modèles d’activité des gènes dans les cellules tumorales., Cela aidera énormément la communauté pharmaceutique à développer des médicaments plus efficaces car les stratégies de traitement seront ciblées directement sur le type spécifique de cancer.

découverte de médicaments: la technologie des puces à puces a une application étendue en pharmacogénomique. La pharmacogénomique est l’étude des corrélations entre les réponses thérapeutiques de médicaments et les profils génétiques des patients. L’analyse Comparative des gènes d’une cellule malade et d’une cellule normale aidera à identifier la constitution biochimique des protéines synthétisées par les gènes malades., Les chercheurs peuvent utiliser ces informations pour synthétiser des médicaments qui combattent avec ces protéines et réduisent leur effet.

Recherches Toxicologiques: technologie des Microréseaux fournit une plate-forme robuste pour la recherche de l’impact des toxines dans les cellules et leur transmission à la descendance. La toxicogénomique établit une corrélation entre les réponses aux toxiques et les changements dans les profils génétiques des cellules exposées à ces toxiques.

GEO

dans un passé récent, la technologie des puces à puces a été largement utilisée par la communauté scientifique., Par conséquent, au fil des ans, il y a eu beaucoup de génération de données liées à l’expression des gènes. Ces données sont dispersées et ne sont pas facilement accessibles au public. Pour faciliter l’accessibilité à ces données, le National Center for Biotechnology Information (NCBI) a formulé le gene Expression Omnibus ou GEO. Il s’agit d’une installation de dépôt de données qui comprend des données sur l’expression des gènes provenant de sources variées.,v id= »0052483fe5″>

Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length
10
99
30
bases
Probe Length tolerance
0
15
3
Probe Target Tm
40
99
63
°C
Probe Tm Tolerance (+)
0.,1
99
5
en Épingle à cheveux Max ÄG
0.1
99.9
4
Kcal/mol
Auto Dimère ÄG
0.1
99.,v id= »0052483fe5″>
Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length
10
99
40
bases
Probe Length tolerance
0
15
3
Probe Target Tm
40
99
70
°C
Probe Tm Tolerance (+)
0.,1
99
5
en Épingle à cheveux Max ÄG
0.1
99.9
6
Kcal/mol
Auto Dimère ÄG
0.1
99.,/div>

Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length
10
99
70
bases
Probe Length tolerance
0
15
3
Probe Target Tm
40
99
75
°C
Probe Tm Tolerance (+/- above)
0.,1
99
5
Hairpin Max ÄG
0.1
99.9
6
Kcal/mol
Self Dimer ÄG
0.1
99.9
8
Kcal/mol
Run/Repeat
2
99
6
bases

Other Parameters

  • Probe Location
    1., Biais d’extrémité 3′: l’oligos choisi doit être vers l’extrémité 3′ du gène, C’est-à-dire par défaut : extrémité 3′.
    2. Les oligos doivent être conçus par défaut dans 999 bases de 3 ‘ fin. La plage peut aller de 0 à 1500 bases.

  • Les oligos doivent être exempts d’homologie croisée (c’est-à-dire qu’ils doivent être fouillés par rapport à la catégorie de génome appropriée).

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