sentrosomin on tärkein microtubule organizing center (MTOC) ihmisen soluissa, ja on laajalti tutkittu siitä lähtien, kun Theodor Boveri ensimmäinen nimeltä ja kuvaili sitä vuonna 1888. Vaikka centrosome on pieni organelle, sillä on suuri merkitys solujen perustoiminnoille. Vieressä sijaitseva tuma, merkittävä rooli sentrosomin on säädellä solun organisaatio mikrotubulukset., Solunjakautumisen aikana, että sentrosomin on avain vastuussa organelliin oikea muodostumista ja suunta mitoosi kara, varmistaa asianmukainen eriyttäminen sisar kromatidia kunkin tytär soluja (Nigg EA ym. (2011)).
Solun Atlas, 548 geenien (3% kaikista proteiini-koodaus ihmisen geenejä) on osoitettu koodaavat proteiineja, jotka paikallistaa että sentrosomin tai centriolar satelliitteja. Kuvat, joissa se on ollut mahdollista erottaa centrioles, proteiineja ollut selityksineen sijainti ”sentrosomin”., Kuvat, joissa centrioles ei ole havaittu, mutta proteiini lokalisoituu keskelle mikrotubulukset, proteiineja ollut selityksineen sijainti ”centriolar satelliitti -” (Kuva 1-2). Toimiva rikastus analyysi sentrosomin proteome osoittaa rikastuminen ehdot biologisia prosesseja, jotka liittyvät solujen organisaatio-ja liikenne -, organisaatio mikrotubulukset, solusyklin etenemisen ja solujen jakautumista.
RAB11FIP5 – A-431
PCNT – U-251 MG
MKKS – U-2 OS
Kuva 1. Esimerkkejä centrosome-ja centriolar-satelliitteihin lokalisoiduista proteiineista., RAB11FIP5 on mukana solunsisäinen liikenne-ja ei ole aiemmin osoittanut, paikallistaa, jotta centrosomes. Käyttämällä itsenäisiä vasta-aineita RAB11FIP5 on lokalisoitu centriolaarisiin satelliitteihin (havaittu a-431-soluissa). PCNT on hyvin ominaista proteiinia komponentti rihmamaiset matriisin sentrosomin tärkeitä rooleja sekä mitoosin ja meioosin (havaittu U-251-solut). MKKS on sentrosomin-shuttling proteiini, joka paikantuu putki-rakenne noin centrioles vuonna pericentriolar material (PCM) ja se on tärkeä solujen jakautumista (havaittu U-2 OS-soluissa)., Normaalisti, MKKS sukkulat välillä sentrosomin ja sytosolissa koko solusyklin mutta kun mutatoitunut, se ei lokalisoida, että sentrosomin, mikä Gittler Kaufman oireyhtymä, sairaus, joka ilmenee, joilla on heikentynyt kehitys, erityisesti käsien ja jalkojen, sekä sydän-ja sukuelinten epämuodostumia.
- 3% (548 proteiineja) kaikista ihmisen proteiineista on kokeellisesti havaittu, että sentrosomin Human Protein Atlas.,
- 145 proteiineja sentrosomin tukevat kokeellista näyttöä ja näistä 36 proteiinit ovat parannettu Human Protein Atlas.
- 428 valkuaisainetta centrosomissa on useita paikkoja.
- 28 proteiineja sentrosomin osoittavat solujen vaihtelua. Näistä 27 osoittaa intensiteetin vaihtelua ja 1 paikkavaihtelua.
- Proteiinit paikallistamisen, että sentrosomin ovat pääasiassa mukana solunsisäinen organisaatio ja liikenne, microtubule organisaatio ja solusyklin etenemistä.
Kuva 2., 3% kaikista ihmisen proteiinia koodaavista geeneistä koodaa centrosomiin tai centriolaarisiin satelliitteihin lokalisoituja proteiineja. Jokainen palkki on klikattava ja antaa hakutuloksen valitulle luokalle kuuluvista proteiineista.
rakenne sentrosomin
Päin
- Centriolar satelliitti: 171
- Sentrosomin: 377
sentrosomin on pieni ei-kalvo sidottu organelle miehittää noin 1-2 µm3 sytoplasman määrä (Doxsey S&aikana; (2001))., Se koostuu kahdesta tynnyrin muotoinen centrioles, kukin koostuu yhdeksän microtubule kolmoset, järjestetään yhdessä kohtisuorassa kulmassa yhteen kuituja. Se centrioles ovat ympäröi amorfinen matriisi proteiineja, joita kutsutaan yleisesti pericentriolar material (PCM), joka sisältää proteiineja mukana nukleaatio ja ankkurointi mikrotubulukset, sekä tärkeää solusyklin sääntelyviranomaisten ja muita molekyylejä. Pericentrin (Kuva 1), γ-proteiinista, ninein, centriolin ja aurora-kinaasien ovat joitakin esimerkkejä (Doxsey S&aikana; (2001)).,Γ-tubuliinin proteiini monimutkainen on erittäin säilytetty monimutkainen, joka muodostaa avoin rengas rakenne, noin 25 nm halkaisijaltaan, ja on keskeinen rooli nukleaatio ja mikrotubulukset. Keskeisenä säädin mitoosin, rakenne ja koostumus sentrosomin on erittäin dynaaminen ja käy läpi dramaattisia organisatorisia muutoksia koko solusyklin (Bornens M&aikana; (2002); Conduit PT et al. (2015)).
centrosomes, sekä pohjapinta kehon ripset, on läheisesti ympäröivät sytoplasman rakeet, tunnetaan centriolar satelliitit (Tollenaere MA et al., (2015); Prosser SL ym. (2020)). Centriolar satelliitit kulkevat mikrotubulukset yhdessä moottorin proteiineja ja ovat tiedossa sisältävät useita proteiineja, jotka ovat myös löydetty centrosomes ja ripset. Centriolaarisia satelliitteja voidaan havaita useimmissa solutyypeissä, mutta niiden koostumus, koko, lukumäärä ja sijainti vaihtelevat. Centriolar satelliitit purkaa tultua mitoosin, bur uudelleen päätyttyä cytokinesis.
taulukossa 1 on valikoima centrosomin ja centriolaaristen satelliittien markkereiksi soveltuvia proteiineja., Taulukossa 2 on esitetty luettelo erittäin ilmentyneistä proteiineista, jotka lokalisoituvat centrosomeiksi ja centriolaarisiksi satelliiteiksi.
Taulukko 1. Centrosome-ja centriolar-satelliittien markkereiksi sopivien proteiinien valinta.,v id=”02794f7097″>
Cytosol
Cytosol
Table 2., Hyvin ilmaistut centrosomin ja centriolaarisen satelliitin merkkiproteiinit eri solulinjoissa., oncogene partner
See the morphology of centrosomes in human induced stem cells in the Allen Cell Explorer.,
toiminto sentrosomin
tärkeä tehtävä sentrosomin on organisaation mikrotubulukset solussa, siten hallitsemaan solujen muoto, napaisuus, joukkotuhoaseiden leviäminen, liikkuvuus ja solujen jakautumista. Aikana S-vaihe, sentrosomin on toistettavissa semi-konservatiivinen tavalla, jolloin muodostuu yksi tytär sentrioli vierekkäin vanhempien centrioles. Kuten solu, lähestymistapoja, mitoosin, kaksi centrosomes, joista jokainen sisältää vanhempien saakka ja kypsymässä procentriole, siirrä vastakkaisissa päissä solun., Samalla ympäröivien PCM-proteiinien määrä kasvaa, mikä mahdollistaa useampien mikrotubulusten nukleaation. Kun ydinvoiman kalvo hajoaa, mikrotubulukset ovat peräisin kunkin centrosomes voivat olla vuorovaikutuksessa kinetokorit on toistettu sisar kromatidia, muodostaen ominaisuus mitoosi kara. Monimutkainen kara laite välittää erottaminen sisar kromatidia vastakkaisille puolille solua, ja kun cytokinesis jokainen tytär solut on varustettu yhdet kromosomeja ja yksi sentrosomin. Vanhempien centrioli, ts., vanhempi kaksi sentrioli pari, on myös keskeinen rooli muodostumista cilia ja flagella. Lisäksi, yhä enemmän todisteita viittaavat enemmän monipuolinen toiminta sentrosomin, erityisesti osoittaa sen kyky koordinoida lukemattomia solutoiminnoille, jonka palveluksessa on kompakti keskus, jossa sytoplasman proteiinit voivat olla vuorovaikutuksessa suurina pitoisuuksina (Doxsey S&aikana; (2001); Rieder CL ym. (2001)).,
Centriolar satelliitit ovat jo pitkään pidetty ajoneuvojen proteiinia ihmiskaupan ja sentrosomin ja ripset, mikä pelissä rooli dynaaminen asetuksen proteiinin koostumus nämä soluelimiin (Tollenaere MA et al. (2015); Prosser SL ym. (2020)). Todellakin, useita proteiineja, jotka paikallistaa, jotta centriolar satelliitit ovat sekaantuneet sentrosomin replikointi, kypsymisen ja erottaminen., Kuitenkin viimeaikaiset tutkimukset, centriolar satelliitteja on tullut myös sääntelyviranomaisten useita muita solun prosesseja, kuten proteiinien hajoamis-ja autophagy, joista jotkut ovat riippumattomia centrosomes ja ripset. Samoin centrosomit ja värekarvat eivät ole täysin riippuvaisia centriolaarisista satelliiteista.,
Kuten avain sääntelyviranomaisten kromosomi eriytymistä ja solusyklin etenemistä, poikkeavuuksia numero, koko ja morfologia sentrosomin, ja mutaatiot geenit koodaavat proteiinia, joka paikallistaa, jotta centrosomes, on yleisesti havaittu solujen käynnissä tuumorigeneesiin, mutta myös joitakin muita sairauksia (Badano JL et al. (2005)).
Gene Ontologia (MENNÄ) perustuva analyysi geenit koodaavat proteiineja, jotka paikallistaa, jotta centrosomes tai centriolar satelliitteja näkyy rikastuminen termit, joilla kuvataan toiminnot, jotka ovat hyvin linjassa olemassa olevaan kirjallisuuteen., Eniten korkeasti rikastetun ehdot MENNÄ domain Biologinen Prosessi liittyvät mitoosin ja cytokinesis, solusyklin etenemistä, endosytoosin, organisaatio microtubule tukiranka, ja organisaatio soluelimiin (Kuva 3a). Rikastus-analyysin MENNÄ domain Molekyyli-Toiminto paljastaa rikastuminen termit, jotka kuvaavat sitoutumisen mikrotubulukset ja moottori proteiineja, sekä moottorin toimintaa (Kuva 3b).
Kuva 3a. Gene Ontologia-pohjainen rikastus analyysi sentrosomin proteome osoittaa merkittävästi rikastettu ehdot MENNÄ domain Biologinen Prosessi., Jokainen palkki on klikattava ja antaa hakutuloksen valitulle luokalle kuuluvista proteiineista.
Kuva 3b. Gene Ontologia-pohjainen rikastus analyysi sentrosomin proteome osoittaa merkittävästi rikastettu ehdot MENNÄ domain Molekyyli-Toiminto. Jokainen palkki on klikattava ja antaa hakutuloksen valitulle luokalle kuuluvista proteiineista.
Sentrosomin proteiineja, joilla on useita paikkoja
Noin 78% (n=428), että sentrosomin ja centriolar satelliitti-proteiinit havaitaan Solun Atlas myös paikallistaa muihin solu-osastoja (Kuva 4)., Verkon juoni osoittaa, että yleisimmät centrosome-ja centriolar-satelliittien kanssa jaetut paikat ovat sytoplasma, tuma ja vesikkelit. Dual lokalisoinneissa kanssa nucleoplasm ja sytosolissa ovat yliedustettuina, kun taas dual lokalisoinneissa kanssa Golgin laitteeseen ja nucleoli ovat aliedustettuina.
Kuva 4. Interaktiivinen verkon juoni mikrotubulusproteiinien useita lokalisointeja. Numerot verkkojen solmut osoittavat, proteiineja, jotka ovat lokalisoitu sentrosomin ja yksi tai useampia muita sijainteja., Vain useamman kuin yhden proteiinin ja vähintään 0,5% valkuaisaineiden yhdistäviä solmuja centrosome-proteomissa on esitetty. Ympyräkoot liittyvät proteiinien määrään. Syaani värilliset solmut näyttää yhdistelmät, jotka ovat merkittävästi yliedustettuina, kun taas magenta värillinen solmut näyttää yhdistelmät, jotka ovat merkittävästi aliedustettuina verrattuna todennäköisyys toteamalla, että yhdistelmä, joka perustuu taajuus jokainen merkintä ja hypergeometrinen testi (p≤0.05). Huomaa, että tämä laskelma tehdään vain proteiineille, joilla on kaksi lokalisointia., Jokainen solmu on klikattava ja tuloksena on luettelo kaikista proteiineista, joita on kytketty organelleja.
Lauseke-tasot sentrosomin proteiineja kudosten
Transcriptome analyysi ja luokittelu geenejä kudoksiin jakautuminen luokkiin (Kuva 8) osoittaa, että sentrosomin ja centriolar satelliitti-proteiinit eivät todennäköisesti näytä mitään tietyn tyyppistä kudosta jakelu, verrattuna kaikki geenit esitetty Solun Atlas.
Kuva 5., Baari juoni osoittaa prosenttiosuuden geenien eri kudoksiin jakautuminen luokkiin geenit koodaavat proteiineja, jotka paikallistaa että sentrosomin tai centriolar satelliitit, verrattuna kaikki geenit Solussa Atlas. Asteriski merkitsee tilastollisesti merkitsevää poikkeamaa (p≤0,05) geenien määrässä kategoriassa binomisen tilastollisen testin perusteella. Jokainen palkki on klikattava ja antaa hakutuloksen valitulle luokalle kuuluvista proteiineista.
relevantit linkit ja julkaisut
Bovery T. 1900. Zellen-Studien. Verlag von Gustav Fischer.