Microarray-Teknologia: johdatus DNA Microarray

Viittauksia >> Microarray

Microarray-Teknologia

Miten microarray-teknologia toimii?

– Bakteerien tunnistaminen käyttäen microarray

– Geenin liittämiseen havaitseminen käyttäen microarray

Johdanto Microarray

Molekyylibiologian tutkimus kehittyy kehittämällä teknologioita, joita käytetään kuljettamaan ne pois., Suurta määrää geenejä ei ole mahdollista tutkia perinteisin menetelmin. DNA Microarray on yksi tällainen tekniikka, jonka avulla tutkijat voivat tutkia ja käsitellä asioita, jotka olivat kerran ajatellut kuin jäljitettävissä. Monien geenien ilmentymistä voi analysoida yhdellä reaktiolla nopeasti ja tehokkaasti. DNA Microarray-teknologia on valta tiedeyhteisön ymmärtää perustavanlaatuinen näkökohdat korostaa kasvun ja elämän kehitystä sekä tutkia geneettisiä syitä poikkeavuuksia esiintyy toiminnan ihmiskehon.,

tyypillinen microarray experiment liittyy hybridisaatio mRNA-molekyyli DNA-malliin, josta se on peräisin. Monia DNA-näytteitä käytetään array. Kuhunkin kohtaan sidotun mRNA: n määrä matriisissa kertoo eri geenien ilmentymistason. Määrä voi nousta tuhansissa. Kaikki tiedot kerätään ja luodaan profiili solun geenien ilmentymistä varten.

Mikroarraytekniikka

joukko on näytteiden järjestyksellinen järjestely, jossa tunnettujen ja tuntemattomien DNA-näytteiden vastaavuus tehdään emäspareja koskevien sääntöjen perusteella., Matriisikokeessa käytetään yhteisiä määritysjärjestelmiä, kuten mikromuoveja tai tavallisia blottauskalvoja. Näyte spot koot ovat tyypillisesti alle 200 mikronia halkaisijaltaan sisältävät yleensä tuhansia paikkoja.

Tuhansia huomasi näytteitä tunnetaan anturit (tunnetaan identiteetti) on immobilisoitu kiinteälle alustalle (mikroskoopin lasi dioja tai pii-sirut tai nylon kalvo). Pilkut voivat olla DNA: ta, cDNA: ta tai oligonukleotideja. Näitä käytetään määrittelemään tuntemattomien sekvenssien toisiaan täydentävä sitoutuminen, mikä mahdollistaa rinnakkaisen analyysin geenien ilmentymisestä ja geenien löytymisestä., Yhden DNA-sirun kokeilu voi antaa tietoa tuhansista geeneistä samanaikaisesti. Hallittu järjestely luotaimet tuki on tärkeää, koska sijainti jokaisen paikan array käytetään tunnistus-geenin.

erilaisia Microarray

Riippuen siitä, millaisia liikkumattomaksi näyte käytetään rakentaa taulukot ja tiedot haettu, Microarray kokeiluja voidaan luokitella kolmella tavalla:

1., Mikroarray Expression Analysis: tässä kokeellisessa asetelmassa tunnettujen geenien mRNA: sta johdettu cDNA on immobilisoitu. Näytteessä on geenejä sekä normaalista että sairaasta kudoksesta. Paikkoja enemmän intensiteettiä saadaan sairaan kudoksen gene jos geeni on yli ilmaistu sairas kunto. Tätä ilmentymäkuviota verrataan sitten taudista vastuussa olevan geenin ilmaisukuvioon.

2. Mikroarray Mutaatioanalyysiin: tätä analyysia varten tutkijat käyttävät gDNA: ta. Geenit saattavat erota toisistaan yhtä vähän kuin yksi nukleotidiemäs.,

kahden sekvenssin välinen yksittäinen emäsero tunnetaan yksittäisenä Nukleotidipolymorfismina (SNP) ja niiden havaitseminen tunnetaan nimellä SNP detection.

3. Vertaileva Genomien Hybridisaatio: Sitä käytetään tunnistamisen nousu tai lasku tärkeää kromosomien palasia kätkeminen geenien sairaus.

Sovellukset Microarray

Gene Löytö: DNA Microarray-teknologia auttaa tunnistamaan uusia geenejä, tietää niiden toiminnan ja ilmaisun tasoilla eri olosuhteissa.,

Tauti Diagnoosi: DNA Microarray-teknologia auttaa tutkijoita oppia lisää eri sairaudet, kuten sydän sairaudet, psyykkinen sairaus, tartuntatauti-ja erityisesti tutkimus syövän. Viime aikoihin asti eri syöpätyypit on luokiteltu niiden elinten perusteella, joihin kasvaimet kehittyvät. Nyt kehitys microarray-teknologia, se on mahdollista, tutkijat edelleen luokitella syöpien perusteella malleja geenin toimintaa kasvain solut., Tämä auttaa valtavasti lääkeyhteisöä kehittämään tehokkaampia lääkkeitä, koska hoitostrategiat kohdennetaan suoraan tietyntyyppiseen syöpään.

Drug Discovery: Microarray-teknologialla on laaja sovellus Farmakogenomiikassa. Farmakogenomiikka on lääkehoitovasteiden ja potilaiden geneettisten profiilien korrelaatioiden tutkimus. Vertaileva analyysi geenien sairaan ja normaalin solun auttaa tunnistaa biokemiallisia perustuslain proteiineja syntetisoidaan sairaat geenit., Tutkijat voivat käyttää tätä tietoa syntetisoida lääkkeitä, jotka taistelevat näiden proteiinien kanssa ja vähentävät niiden vaikutusta.

Myrkyllisyyteen liittyvät Tutkimus: Microarray-teknologia tarjoaa vankan pohjan tutkimuksen vaikutus toksiinien soluista ja niiden toimittaminen jälkeläiset. Toxicogenomics vahvistetaan korrelaatio vastauksia myrkyt ja muutokset geneettiset profiilit solut altistuvat tällaisia myrkyt.

GEO

lähimenneisyydessä mikroarray-tekniikkaa on käytetty laajasti tiedeyhteisössä., Näin ollen geenien ilmentymiseen liittyvää dataa on vuosien saatossa syntynyt paljon. Nämä tiedot ovat hajallaan, eikä niitä ole helposti saatavilla julkiseen käyttöön. Helpottaa saatavuutta, tietojen, National Center for Biotechnology Information (NCBI) on muotoiltu Geenien Ilmentyminen Omnibus tai GEO. Se on tietorekisteri, joka sisältää tietoa geenien ilmentymisestä eri lähteistä.,v id=”0052483fe5″>

Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length Probe Length tolerance Probe Target Tm Probe Tm Tolerance (+) Hiusneula Max ÄG Itse Dimeeri ÄG Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length Probe Length tolerance Probe Target Tm Probe Tm Tolerance (+) Hiusneula Max ÄG Itse Dimeeri ÄG