Arboretum sijaitsee jäljellä osa Rancho Santa Anita, yksi Meksikon maa avustuksia Etelä-Kaliforniassa. Rancho Santa Anita oli sikäli erikoinen, että se sijaitsi suuren osan Raymond Basin-pohjavesialueen yläpuolella. Alueelta löytyi kolme sag-lampea ja lukuisia lähteitä, ja ainoa jäljellä oleva on nykyään nimeltään Baldwin Lake. Lacy Park San Marinon kaupungissa oli aikoinaan toinen sag-lampi, eikä kolmannen tarkkaa sijaintia tiedetä, mutta se saattoi sijaita Huntingtonin kirjaston ja Kasvitieteellisen puutarhan alueella., Seurauksena suhteellinen runsaus, se oli tärkeä alue esihistoriasta kuin ympäri vuoden lähde vesi, vesistö tunnetaan Baldwin Lake ja muut sag lammet herättänyt sekä vesilinnut ja muut eläimet sekä Native Amerikkalaiset. Ei ole yllättävää, läsnäolo vettä ja peli luotu pysyvä Native American asutus alueella ja on uskotaan ovat olleet sijainti Tongva kylän Aleupkigna., Lähellä sijaitsee lähellä San Gabriel Mission on saattanut johtaa rakentamisen pieni kausiluonteinen asunnossa Arboretum-sivusto paimenia tai metsästäjät, joka lopulta johti rakentamisen vaatimaton adobe rakenne.
vuonna 1839 Rancho Santa Anitan apuraha myönnettiin Hugo Reidille (1809-1852) ja hänen Tongva-vaimolleen Victorialle. Reid rakensi vuonna 1839 savitiilikodin järven rannalle, joka on nykyään Kalifornian historiallinen maamerkki. Reid oli koulutukseltaan skotti, joka tunnettiin Tongvan kulttuuria kuvaavista kirjeistä., Muuten Reid lienee parhaiten tunnettu roolistaan vuoden 1849 Kalifornian perustuslakikonventissa. Tuberkuloosiin sairastunut mies kuoli 43-vuotiaana. Perässä tuli joukko kiinteistön lyhytaikaisia omistajia, Rancho Santa Anita.
Myöhemmät omistajat Rancho Santa Anita olivat, tässä järjestyksessä, Henry Dalton, Joseph A. Rowe, Albert Dibblee yhteistyössä William Padmore ja Herra Barker, Leonard Nousi ja William Wolfskill, Alfred Chapman Harris Newmark kunnes lopulta omaisuus myytiin Elias Jackson Baldwin., Jokaisen siirtymisen myötä, alkaen myynnistä Roselle ja Wolfskillille, osa karjatilasta myytiin pois. Jokainen omistaja tavallaan esikuvasi Etelä-Kalifornian historiaa kauden aikana. Maatalouden innovaatiot on ominaisuus, joka jatkui hyödyntää ilmasto-ja uusia kasveja, että se on tehnyt mahdolliseksi sekä kasvava kuluttajien ja uusia markkinoita avataan kuljetus innovaatioita.
Vuonna 1875, kun Elias Jackson ”Onnekas” Baldwin ostaa Rancho Santa Anita ja rakennettu sen rakennukset ja maa., Baldwinin vaikutus näkyi mahtipontisesti Oakwood-hotellin ja Santa Anita-raviradan näyteikkunan luomisessa. Kaupallinen viininviljely kukoisti San Gabriel Missionin ympärillä lähetyspäivistä lähtien. Baldwin alkoi palkittu viinitila toimittaa turisteja, myydään maa uudisasukkaita sekä käynnissä oma vesilaitos ja tiili toimii. Kumppanuuden Henry E. Huntington ja Santa Fe Railroad vakuutettu, että matkustajat voivat saapua junalla Los Angeles ja muissa paikoissa sekä jolloin rahti, kuten rakennustarvikkeet ja aluksen karjatila tuottaa.,
arboretum alkoi vuonna 1947 Kaliforniassa ja Los Angelesissa yhdessä ostamalla 111 hehtaaria (44.9 ha) luoda arboretum ympäri Baldwin sivuston. Vuoteen 1949 mennessä ensimmäinen kasvihuone oli rakennettu ja alueen kasvit inventoitu. Vuonna 1951 istutettiin ensimmäiset 1 000 puuta, ja vuonna 1956 arboretum avattiin yleisölle. Puutarhojen ja kasvihuoneiden rakennustyöt jatkuivat 1950-ja 1960-luvuilla, ja vuosina 1975-1976 avattiin trooppinen kasvihuone ja valmistui esihistoriallinen ja Viidakkopuutarha. Sekä kasvihuoneiden että puutarhojen rakentaminen ja remontointi jatkuu.,
Pohjaveden lampia ja pumppaamo on ehdottanut Los Angeles County Department of Public Works ja konsortion viiden kaupunkien foothill 4 hehtaaria (1,6 ha) ja Australia-osiossa.