Ra ’ s al Ghul tajuaa virheensä palkata Jokeri käyttää häntä häiriötekijä, kun Ra on tuhonnut Euroopan taloudelliset piirit. Sarajevossa, Bosnia, Jokeri on siepattu ja raa ’ asti pahoinpitelyt Jason Toddin, toisen Robinin, hylätty varasto sorkkaraudalla. Jason lukitaan varastoon pommin kanssa, joka räjähtää ja tappaa hänet ennen Batmanin saapumista.
Viisi vuotta myöhemmin Gotham City, salaperäinen kostaja nimeltä Red Hood kokoaa kokouksessa kaupungin näkyvin huumekauppiaita., Hän ilmoittaa haltuunotto huumeiden kaupan, kun vain 40 prosenttia voittoa ja tarjoaa suojaa sekä Musta Maski ja Batman – kuoleman uhalla ketään kiinni huumeiden lapsille. Batman pysäyttää Black maskille kuuluvan lähetyksen varkausyrityksen, joka on kehittynyt android Amatso. Batman tuhoaa Laivan avulla Jason edeltäjä Nightwing ja huomaa varkaat työskentelevät Punainen Huppu. Hän jahtaa Punahuppua Ace Chemicalsille, jossa räjähdys tuhoaa laitoksen ja melkein tappaa Batmanin.,
Jason Todd Red Hood (vas.) ja Robin (keskellä ja oikealla)
Batman ja Nightwing kuulustella Jokeri klo Arkham Asylum noin Punainen Huppu, mutta hän kieltää sen. Musta naamio iskee Punahuppuun Amatson tuhon vuoksi. Batman ja Nightwing estävät Punahuppua kaappaamasta Black Maskin seuraavaa aselähetystä. He jahtaavat Punahuppua rautatieasemalle, josta Punahuppu pakenee räjäytettyään Nightwingia vahingoittavan pommin., Batman ja Nightwing tajuavat, että Punahuppu on koulutettu ja hänellä on tietoa Batmanin taktiikasta ja gadgetriasta. Katselmus takaa-ajon äänikuvasta paljastaa, että Punahuppu tietää Batmanin salaisen henkilöllisyyden. Sitten hän muistuttaa, Jason tekevät samaa liikkeitä, kuten Robin, ja että Jason kasvoi enemmän väkivaltainen ja verenhimoinen kuin hän ikäinen, jossa Batman ottaa pysäyttää hänet monta kertaa lähes tappaa rikollisia.
Pelottavan nelikon houkutella ulos Punainen Huppu hyökkäämällä Tyler Bramford, huumekauppias hänen suojeluksessaan., He melkein voittivat hänet, kunnes Batman auttaa lamauttamaan kolme heistä ja Punahuppu tappaa neljännen, kauhistuttavan Batmanin. Punahuppu selittää tekevänsä sitä, mitä Batman ei tee: tappavansa pelottomia rikollisia. Batman tarjoutuu auttamaan Punahuppua, mutta hän kieltäytyy.
Batman analysoi verinäytteen Punainen Huppu peräisin taistelu ja se vastaa Jason on. Tutustumisen jälkeen Jason ruumis on väärennös, Batman kohtaa Ra ’ s al Ghul ja vaatii saada tietää totuuden., Ra ’ s kertoo, että hän tunsi vastuussa Jason kuolemasta ja rauhaa, hän vaihtoi Jasonin ruumiin fake ja elvytti hänet Lazarus Pit. Ylösnousemuksensa jälkeen Jason ajettiin hulluksi ja hän pakeni hyppäämällä jyrkänteeltä, jonka Ra ’ s miehineen uskoi tappaneen hänet.
selvittyään murhayrityksestä Red Hood, Musta Maski asetetaan Jokeri free, ohjaan hänet tappaa Punainen Huppu. Joker kuitenkin sen sijaan kidnappaa mustan maskin ja huumekauppiaat ja sytyttää heidät tuleen; Punahuppu ilmestyy ja paljastaa todellisen kohteensa koko ajan olleen Jokeri., Batman pelastaa panttivangit ja Punahuppu ottaa Jokerin. Punahuppu hyökkää julmasti Jokerin kimppuun kostaakseen oman murhansa ja kohtaa Batmanin. Ottelun aikana Punahuppu riisuu kypäränsä ja vahvistaa olevansa Jason. Heidän taistelunsa etenee ränsistyneeseen rakennukseen, jossa Jason pitää Jokeria ja päättyy Jasonin pitäessä Batmania aseella uhaten. Vaikka hän on antanut Batmanille anteeksi, ettei hän ole pelastanut häntä, Jason on järkyttynyt siitä, että Joker on yhä elossa surmattuaan hänet. Batman myöntää miettineensä jatkuvasti Jokerin kiduttamista ja tappamista, mutta ei aio, peläten ettei lopeta, jos hän tappaa edes kerran., Jason heittää Batmanille aseen ja antaa tälle uhkavaatimuksen-hän teloittaa Jokerin, ellei Batman ammu häntä. Batman kieltäytyy ja pudottaa aseen, jolloin Jason ampuu häntä kohti. Batman heittää batarangin, joka jumittaa Jasonin pistoolin. Kun Jason vetää liipaisimesta uudelleen, ase tuhoutuu ja Jasonin oikea käsi murretaan. Voitettuaan Jason laukaisee aikapommin ja Batman taltuttaa Jokerin ennen kuin yrittää pelastaa Jasonin. Pommi räjähtää; Batman ja Jokeri selviävät, mutta Jason on poissa.
Jokeri palautetaan Arkhamiin ja Black Mask pidätetään osallisuudesta Jokerin pakoon., Takaumassa nähdään Jasonin ensimmäinen päivä Robinina, jonka hän julistaa olevan elämänsä paras päivä.