Microarray-Teknologi: En introduktion til DNA-Microarray

Henvisninger >> Microarray

Microarray-Teknologi

Hvordan microarray teknologi fungerer?

Bakteriel identifikation ved hjælp af microarrays

Gen-splejsning detection ved hjælp af microarrays

Introduktion til Microarray

molekylærbiologisk forskning, der udvikler sig gennem udvikling af de teknologier, der anvendes til at udføre dem., Det er ikke muligt at undersøge et stort antal gener ved hjælp af traditionelle metoder. DNA Microarray er en sådan teknologi, som gør det muligt for forskerne at undersøge og løse problemer, som engang blev anset for at være ikke sporbar. Man kan analysere ekspressionen af mange gener i en enkelt reaktion hurtigt og på en effektiv måde. DNA Microarray-teknologi har bemyndiget det videnskabelige samfund til at forstå de grundlæggende aspekter, der understreger livets vækst og udvikling, samt at undersøge de genetiske årsager til anomalier, der forekommer i menneskets funktion.,

et typisk mikroarray-eksperiment involverer hybridisering af et mRNA-molekyle til DNA-skabelonen, hvorfra det stammer fra. Mange DNA-prøver bruges til at konstruere et array. Mængden af mRNA bundet til hvert sted på arrayet angiver ekspressionsniveauet for de forskellige gener. Dette tal kan løbe i tusinder. Alle data indsamles og en profil genereres for genekspression i cellen.

Microarray Teknik

et array er En ordnet arrangement af prøver, hvor matchning af kendte og ukendte DNA-prøver, der er gjort baseret på base parring regler., Et array eksperiment gør brug af fælles assay systemer såsom mikroplader eller standard blotting membraner. Prøvespotstørrelserne er typisk mindre end 200 mikron i diameter indeholder normalt tusinder af pletter.

tusinder af plettede prøver kendt som sonder (med kendt identitet) immobiliseres på en solid understøtning (et mikroskop glasskinner eller siliciumchips eller nylonmembran). Pletterne kan være DNA, cDNA eller oligonukleotider. Disse bruges til at bestemme komplementær binding af de ukendte sekvenser, hvilket muliggør parallel analyse af genekspression og genopdagelse., Et eksperiment med en enkelt DNA-chip kan give oplysninger om tusindvis af gener samtidigt. En ordentlig arrangement af sonder på støtte er vigtig, da placeringen af hver plet på arrayet anvendes til identifikation af et gen.

Typer af Microarrays

Afhængig af type af immobiliseret prøve, der anvendes konstruere arrays, og de oplysninger, der hentes, Microarray experiments kan kategoriseres i tre måder:

1., Microarray e .pression Analysis: i denne eksperimentelle opsætning er cDNA afledt af mRNA af kendte gener immobiliseret. Prøven har gener fra både det normale såvel som de syge væv. Pletter med mere intensitet opnås for syge væv gen, hvis genet er over udtrykt i den syge tilstand. Dette ekspressionsmønster sammenlignes derefter med ekspressionsmønsteret for et gen, der er ansvarligt for en sygdom.

2. Mikroarray til mutationsanalyse: til denne analyse bruger forskerne gDNA. Generne kan afvige fra hinanden ved så mindre som en enkelt nukleotidbase.,

en enkelt baseforskel mellem to sekvenser er kendt som enkelt Nukleotidpolymorfisme (SNP), og detektere dem er kendt som SNP-detektion.

3. Sammenlignende genomisk hybridisering: det bruges til identifikation i stigningen eller faldet af de vigtige kromosomale fragmenter, der indeholder gener involveret i en sygdom.

anvendelser af mikroarrays

genopdagelse: DNA-mikroarray-teknologi hjælper med at identificere nye gener, vide om deres funktions-og ekspressionsniveauer under forskellige forhold.,

sygdomsdiagnose: DNA Microarray-teknologi hjælper forskere med at lære mere om forskellige sygdomme som hjertesygdomme, psykisk sygdom, infektionssygdom og især studiet af kræft. Indtil for nylig er forskellige typer kræft blevet klassificeret på grundlag af de organer, hvor tumorerne udvikler sig. Nu med udviklingen af mikroarray-teknologi vil det være muligt for forskerne at klassificere kræfttyperne yderligere på grundlag af mønstrene for genaktivitet i tumorcellerne., Dette vil enormt hjælpe det farmaceutiske samfund med at udvikle mere effektive lægemidler, da behandlingsstrategierne vil blive målrettet direkte mod den specifikke type kræft.

Drug Discovery: Microarray teknologi har omfattende anvendelse i farmakogenomik. Farmakogenomik er undersøgelsen af korrelationer mellem terapeutiske reaktioner på lægemidler og patienternes genetiske profiler. Sammenlignende analyse af generne fra en syg og en normal celle vil hjælpe identifikationen af den biokemiske sammensætning af proteinerne syntetiseret af de syge gener., Forskerne kan bruge disse oplysninger til at syntetisere stoffer, der bekæmper med disse proteiner og reducerer deres virkning.

toksikologisk Forskning: Microarray-teknologi giver en robust platform til forskning i toksiners indvirkning på cellerne og deres overførsel til afkommet. To .icogenomics etablerer sammenhæng mellem reaktioner på toksik og ændringerne i de genetiske profiler af cellerne udsat for sådanne toksik.

GEO

i den seneste tid, microarray teknologi er blevet flittigt brugt af det videnskabelige samfund., Derfor har der i årenes løb været en masse generering af data relateret til genekspression. Disse data er spredt og er ikke let tilgængelige til offentlig brug. For at lette tilgængeligheden til disse data har National Center for Biotechnology Information (NCBI) formuleret Genekspressionen Omnibus eller GEO. Det er en datalagringsfacilitet, der indeholder data om genekspression fra forskellige kilder.,v id=”0052483fe5″>

Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length Probe Length tolerance Probe Target Tm Probe Tm Tolerance (+) Hårnål Antal ÄG Self-Dimer ÄG Parameter Minimum Value Maximum Value Default Value Unit Probe Length Probe Length tolerance Probe Target Tm Probe Tm Tolerance (+) Hårnål Antal ÄG Self-Dimer ÄG