Nukleinsäuremoleküle haben ein Phosphoryl (5′) – Ende und ein Hydroxyl (3′) – Ende. Diese Notation folgt aus der Nomenklatur der organischen Chemie und kann verwendet werden, um die Bewegung von Enzymen wie DNA-Polymerasen relativ zum DNA-Strang auf nicht willkürliche Weise zu definieren.
G-quadruplexesEdit
Die verschiedenen Arten von Topologien in G-quadruplex -, propeller -, seitliche und Diagonale.,
G-Quadruplexe, auch G4-DNA genannt, sind sekundäre Strukturen, die in Nukleinsäuren vorkommen, die reich an Guanin sind. Diese Strukturen befinden sich normalerweise an den Telomeren (den Enden der Chromosomen). Der G-Quadruplex kann je nach Schleifenkonfiguration, die Bestandteil der Struktur ist, entweder parallel oder antiparallel sein. Wenn alle DNA-Stränge in die gleiche Richtung verlaufen, wird es als paralleler Quadruplex bezeichnet und als Strangumkehr/Propeller bezeichnet, der benachbarte parallele Stränge verbindet., Wenn einer oder mehrere der DNA-Stränge in entgegengesetzter Richtung verlaufen, wird er als antiparalleler Quadruplex bezeichnet und kann entweder in Form eines lateralen/kantenweisen Strangs, der benachbarte antiparallele Stränge verbindet, oder einer diagonalen Stränge sein, die zwei diagonal gegenüberliegende Stränge verbinden. Die Struktur dieser G-Quadruplexe kann durch ein Kation bestimmt werden.
DNA-replikationEdit
In der DNA befindet sich der 5′ – Kohlenstoff oben am führenden Strang und der 3′ – Kohlenstoff im unteren Abschnitt des verzögerten Strangs., Die Nukleinsäuresequenzen sind komplementär und parallel, gehen aber in entgegengesetzte Richtungen, daher die Antiparallelbezeichnung. Die Antiparallelstruktur der DNA ist wichtig für die DNA-Replikation, da sie den führenden Strang in die eine und den verzögerten Strang in die andere Richtung repliziert. Während der DNA-Replikation wird der führende Strang kontinuierlich repliziert, während der verzögerte Strang in Segmenten repliziert wird, die als Okazaki-Fragmente bekannt sind.,
Antiparallelismus in der Biochemieedit
Die Bedeutung einer antiparallelen DNA – Doppelhelixstruktur beruht auf ihrer Wasserstoffbindung zwischen den komplementären stickstoffhaltigen Basenpaaren. Wenn die DNA-Struktur parallel wäre, wäre die Wasserstoffbindung nicht möglich, da die Basenpaare nicht auf die bekannte Weise gepaart wären. Die vier Basenpaare sind: Adenin, Guanin, Cytosin und Thymin, wobei Adenin Thymin und Guanin Cytosin ergänzt., Die Transkription wäre ein weiteres Problem, wenn die DNA-Struktur parallel wäre und keinen Sinn für die Informationen ergibt, die aus der DNA gelesen werden. Dies würde weiter zur Produktion falscher Proteine führen.